PLoS ONE: BRAF Mutationer i fremskredne kræftformer: kliniske karakteristika og Outcomes

Abstrakt

Baggrund

oncogen

BRAF

mutationer er blevet fundet i forskellige maligniteter og aktivere RAF /MEK /ERK-signalering, en kritisk pathway tumorigenese. Vi undersøgte de kliniske karakteristika og resultater af patienter med mutant (mut)

BRAF

fremskreden kræft henvises til fase 1 klinik.

Metoder

Vi anmeldt optegnelser 80 konsekutive patienter med

mutBRAF

avancerede maligniteter og 149 med vildtype (

wt

)

BRAF

(modsvares af tumortype) henvist til Clinical center for målrettet terapi og analyseret deres udfald .

Resultater

af 80 patienter med

mutBRAF

fremskreden kræft, 56 havde melanom, 10 kolorektal, 11 papillær skjoldbruskkirtlen, 2 æggestokkene og en kræft i spiserøret. Mutationer i codon 600 blev fundet i 77 patienter (62,

V600E

, 13,

V600K

, 1,

V600R

, 1, urapporteret). Multivariat analyse viste mindre blødt væv (Odds ratio (OR) = 0,39, 95% CI: 0,20 til 0,77, P = 0,007), lunge (OR = 0,38, 95% CI: 0,19-0,73, p = 0,004) og retroperitoneale metastaser ( OR = 0,34, 95% CI: 0,13 til 0,86, p = 0,024) og flere hjernemetastaser (OR = 2,05, 95% CI: 1,02-4,11, P = 0,043) hos patienter med

mutBRAF

versus

wtBRAF

. Sammenligning til den tilsvarende

wtBRAF

,

mutBRAF

melanom patienter havde ubetydelig tendens til længere median overlevelse fra diagnose (131 vs 78 måneder, p = 0,14), mens

mutBRAF

kolorektal cancer patienter havde en ubetydelig tendens til kortere median overlevelse fra diagnose (48 vs. 53 måneder, p = 0,22). I melanom,

V600K

mutationer i forhold til andre

BRAF

mutationer var forbundet med hyppigere hjerne (75% vs. 36,3%, p = 0,02) og lungemetastaser (91,6% vs. 47,7 %, p = 0,007), og kortere tid fra diagnose til metastaser og død (19 vs 53 måneder, p = 0,046 og 78 vs. 322 måneder, p = 0,024 henholdsvis). Behandling med RAF /MEK målretning agenter (Hazard ratio (HR) = 0,16, 95% CI: 0,03 til 0,89, p = 0,037) og en formindskelse af tumorstørrelse efter henvisning (HR = 0,07, 95% CI: 0,015 til 0,35, p = 0,001) korreleret med længere overlevelse i

mutBRAF

patienter.

konklusioner

BRAF

synes at være en druggable mutation, der også definerer undergrupper af patienter med fænotypisk overlap, om end med forskelle, der korrelerer med histologi eller stedet for mutation

Henvisning:. El-Osta H, Falchook G, Tsimberidou A, Hong D, Naing A, Kim K, et al. (2011)

BRAF

Mutationer i fremskredne kræftformer: kliniske karakteristika og resultater. PLoS ONE 6 (10): e25806. doi: 10,1371 /journal.pone.0025806

Redaktør: Hava Karsenty Avraham, Beth Israel Deaconess Medical Center, USA

Modtaget: Marts 12, 2011; Accepteret: 12. september 2011; Udgivet: 19 oktober 2011

Copyright: © 2011 El-Osta et al. Dette er en åben adgang artiklen distribueres under betingelserne i Creative Commons Attribution License, som tillader ubegrænset brug, distribution og reproduktion i ethvert medie, forudsat den oprindelige forfatter og kilde krediteres

Finansiering:. Understøttes i del af Grant nummer RR024148 fra National center for Research Resources, en komponent af National Institutes of Health køreplan for medicinsk forskning. De finansieringskilder havde ingen rolle i studie design, indsamling af data og analyse, beslutning om at offentliggøre eller tilberedning af manuskriptet

Konkurrerende interesser:. Dr. Razelle Kurzrock modtog kommercielle forskningsbevillinger fra GlaxoSmithKline, AstraZeneca, Genentech og Bayer. Dr. Gerald Falchook modtog kommerciel forskningsbevilling fra GlaxoSmithKline. Dette ændrer ikke forfatternes tilslutning til alle de PLoS ONE politikker på datadeling og materialer.

Introduktion

De RAS proteiner regulerer celleproliferation, overlevelse og differentiering ved at aktivere en række nedstrømseffektorer , herunder RAF-proteinkinasen. Når den er aktiveret, RAF stimulerer en signaleringskaskade involverer MEK /ERK pathway. BRAF, en serin-threonin-kinase, er en af ​​tre RAF-proteinkinasen familiemedlemmer (araf, BRAF og ku) [1].

BRAF

proto-onkogen er for nylig været genstand for intensiv forskning, som dens mutation konstitutivt aktiverer RAF /MEK signalering, en vigtig drivkraft for carcinogenese i forskellige maligniteter, især i melanom, tyktarmskræft, og papillær skjoldbruskkirtel cancer

1. Den mest almindelige

BRAF

mutationen er en substitution af glutaminsyre til valin i codon 600 (V600E) [2] -. [3]

I de senere år et væld af lovende forbindelser, som målretter RAS /RAF /MEK-vejen har indtastet kliniske forsøg, nogle af dem viser lovende klinisk aktivitet, primært i kræft med

BRAF

mutationer [4] – [6]. Derfor tester til aktivering mutationer i

BRAF

er blevet mere almindelig, især hvis patienterne skal behandles med BRAF-hæmmere eller andre pathway modulatorer såsom MEK-inhibitorer.

Onkogene mutationer såsom

BRAF

forekomme på tværs af forskellige tumortyper. Heri undersøgte vi kliniske funktioner og resultatet er forbundet med tilstedeværelsen af ​​

BRAF

mutationer, med de vigtigste mål er at skitsere kliniske og prognostiske karakteristika forbundet med tilstedeværelsen af ​​

BRAF

mutationer, hvorvidt specifik

BRAF

mutationer har en tydelig klinisk forløb, samt forudsigende effekt af målrettet behandling.

Metoder

Patienter

fra i januar 2006, vi undersøgte

BRAF

mutation status hos patienter med fremskredne tumorer og tilgængelig væv henvist til Clinical center for målrettet terapi ved Institut for Investigational Cancer Therapeutics (fase i kliniske forsøg Program) på The University of Texas MD Anderson Cancer center. Registreringen af ​​patienter i databasen, patologi vurdering og mutationsanalyse blev udført ved MD Anderson. I alt 80 konsekutive patienter med

BRAF

mutationer blev udvalgt.

For at definere særlige kendetegn ved mutant (mut)

BRAF

fremskredne kræftformer, valgte vi en kontrolgruppe af fortløbende patienter med vildtype (wt)

BRAF

fremskredne kræftformer ses på vores center i samme periode, og matches i et 01:02 forhold ved tumortype med

mutBRAF

patienter.

MD Anderson Cancer center Institutional Review Board har godkendt undersøgelsen. Skriftligt samtykke blev givet af patienterne for deres oplysninger, der skal lagres på hospitalet databasen og bruges til forskning.

Vævsprøver og mutationsanalyse

Archival formalinfikserede, paraffinindlejrede væv blokke eller materiale fra fin-nål aspiration biopsi opnået fra diagnostiske og /eller terapeutiske procedurer blev anvendt til at teste for

BRAF

mutationer. Alle patologi var centralt bekræftet på MD Anderson.

BRAF

mutation test blev udført i en Clinical Laboratory Improvement Ændring-certificeret Molekylær Diagnostisk Laboratorium i afdelingen for Patologi og Laboratory Medicine ved MD Anderson. DNA blev ekstraheret fra mikro-dissekeret paraffinindlejrede tumorsektioner og analyseret under anvendelse af en polymerasekædereaktion (PCR) -baseret DNA-sekventering fremgangsmåde til

BRAF

kodoner 595-600 mutationer i exon 15 af pyrosekventering som tidligere beskrevet [7 ]. Substitution af glutaminsyre til valin i codon 600 benævnes V600E; V600K betegner substitution af lysin for valin; V600R, arginin for valin.

Når det er muligt, vi testet for andre mutationer såsom

EGFR

(exon 18 og 21) [8],

KIT

(exon 11, 13 og 17) [9],

PIK3CA

(exon 9 og 20) [10],

NTM

og

KRAS

(exon 2) [7], [11 ]. PTEN tab blev vurderet ved hjælp af immunhistokemi (monoklonalt muse-anti-human PTEN, klon 6H2.1, Dako®, Danmark) [12].

Kliniske karakteristika og evaluering behandling

Alle kliniske variabler blev vurderet ved gennemgang af den elektroniske journal. Behandling effekt blev evalueret fra computertomografi (CT) scanninger og /eller magnetisk resonans imaging (MRI) ved baseline før behandlingsstart og derefter omkring hver 6 til 8 uger. Alle røntgenbilleder blev læst på Institut for radiologi på MD Anderson og revideret på Institut for Investigational Cancer Therapeutics tumor måling klinik.

Prognostisk vurdering blev gjort ved hjælp af Royal Marsden Hospital (RMH) [13] prognostisk score som følger : 0 point, normal laktat dehydrogenase (LDH), albumin ≥3.5 g /dl, en ≤2 metastatiske steder; 1 punkt-LDH øvre normalgrænse, albumin 3,5 g /dl, 2 metastatiske sites. Patienter med 0-1 point havde en god RMH score, og patienterne med 2-3 point havde en dårlig RMH score.

Statistisk analyse

Statistisk analyse blev bekræftet ved vores statistiker (SW). Følgende kovarianter vedrørende patientkarakteristika blev analyseret: type kræft, alder, køn, race, personlig historie af kræft, historie af rygning eller alkoholisme, familie historie af kræft, sted og antal metastaser, tilstedeværelse af ascites, pleural effusion eller dyb venøs trombose, tumormarkører (CEA, CA 19-9, CA125, CA27.29), lactatdehydrogenase, albumin, hæmoglobin, hvide blodlegemer, blodplader, calcium niveau, stedet for mutation, tilstedeværelsen af ​​andre afvigelser (

PIK3CA

,

de nationale tilsynsmyndigheder eller KRAS

,

KIT

mutation og

PTEN

tab), dato for diagnose, lokalt fremskreden sygdom, fjernmetastaser, henvisning, død eller dato sidste opfølgning, information om bedste standard systemisk behandling for metastatisk sygdom og behandling med fase 1-studie.

Beskrivende statistik blev brugt til at opsummere patientkarakteristika. Fisher eksakt test blev anvendt til at teste for enhver forbindelse mellem to kategoriske variable. Mann-Whitney U test blev anvendt til at teste for association mellem alder og

BRAF

mutation status.

Samlet overlevelse (OS) blev målt (fremgangsmåde til Kaplan-Meier) fra tidspunktet for diagnosen, dato for metastaser, eller dato for forelæggelse for dødsdagen eller sidste opfølgning, alt efter hvad skete først. Patienter i live blev censureret i sidste opfølgning date. Progressionsfri overlevelse (PFS) blev defineret som tidsintervallet mellem starten af ​​behandlingen til den første observation af sygdomsprogression (bestemt ved respons evalueringskriterier i solide tumorer (RECIST) [36] eller død, alt efter hvad der kom først. Patienter live og uden sygdomsudvikling blev censureret i sidste opfølgende date. sygdomsfri overlevelse blev målt fra diagnosetidspunktet for første fjernmetastaser. Log-rank test blev anvendt til at sammenligne OS eller PFS blandt undergrupper. Multivariat analyse med Cox proportionel risiko regressionsmodel blev anvendt til at vurdere en uafhængig forening mellem en karakteristika og PFS eller OS. “Enter” metode blev anvendt, hvor alle variabler er indtastet i modellen uden at kontrollere. Binary logistisk regression metode blev anvendt til at teste for enhver selvstændig sammenhæng mellem en kategorisk variabel og

BRAF

mutationsstatus. metoden “enter” blev brugt, hvor alle variabler er indtastet i modellen uden at kontrollere. alle tests var to-sidet. En p-værdi mindre end 0,05 blev betragtet som statistisk signifikant. Statistisk analyse blev udført ved hjælp af SPSS (version 17,0, SPSS, Chicago, IL, USA)

Resultater

Patient karakteristika

I alt 80 patienter med fremskredne tumorer og

mutBRAF

blev identificeret. Den mediane alder var 52 år (spændvidde, 18-78 år), og 43 var mænd (54%). Størstedelen af ​​patienterne havde melanom (n = 56, 70%) efterfulgt af papillær thyreoideakarcinom (n = 11, 14%), colorectal cancer (n = 10, 13%), og andre typer tumorer (ovariecancer, n = 2 , 2%, kræft i spiserøret, n = 1, 1%) (hvilket afspejler indbringelsen mønstre til vores klinik), (tabel 1)

De mest almindelige metastatiske steder var lunger (n = 48, 60. %), overfladiske lymfeknuder (n = 39, 49%), bughinde (n = 33, 41%), lever (n = 31, 39%), hjerne (n = 27, 34%), blødt væv (n = 26, 33%), knogler (n = 20, 25%) og retroperitoneale lymfeknuder (n = 9, 11%).

Vi identificerede 149 kontrol patienter med fremskredne kræftformer, der er testet negative for

BRAF

mutationer i den samme periode, og der blev matchet på et 01:02 grundlag af tumortype med

mutBRAF

patienter. For papillær kræft i skjoldbruskkirtlen, blev matchende gjort med en 1:01 forhold som følge af et utilstrækkeligt antal patienter, der er nævnt som havde test udført og testet negative for

BRAF

mutation. De detaljerede patientkarakteristika er vist i tabel 1.

Grupper med

mutBRAF

wtBRAF

var ens med hensyn til gennemsnitlige tid fra diagnose til forelæggelse for fase 1 klinik som beregnes ved log-rank-metoden (12 vs. 12,7 måneder, p = 0,95). Initial kræft iscenesættelse ved diagnosen blev også ligeligt fordelt mellem de to grupper. Patienterne blev behandlet på et klinisk forsøg, hvis de havde undladt at reagere på konventionel behandling. Når det er muligt, patienter med

mutBRAF

blev tilbudt behandling rettet mod RAF /MEK vej. Patienterne havde en median på to tidligere behandlinger, uanset BRAF status.

Typer af

BRAF

mutationer

Af de 80 patienter med

mutBRAF

, 77 (96%) havde mutationer i codon 600 og to (3%) i codon 601. En (1%) patient havde samtidige mutationer i kodonerne 599 og 600. af de 77 patienter med codon 600

mutBRAF

, 62 (81%) havde

V600E Salg mutationer (melanom, n = 40; colorectal, n = 8; papillær thyroidcancer, n = 11; esophageal, n = 1 og ovarie-, n = 2), 13 (17 %)

V600K

mutationer (melanom, n = 12; kolorektal cancer, n = 1), 1 (1%)

V600R

mutation (melanom, n = 1) og en af ​​urapporteret typen (kolorektal, n = 1) (tabel 1).

BRAF

mutationer og kliniske funktioner

univariate analyse.

Patientens alder på diagnosetidspunktet var betydeligt yngre patienter med

mutBRAF

(median alder = 52 år) versus

wtBRAF

sygdom (median alder = 58 år) (p = 0,002). Mænd blev mere almindeligt repræsenteret i både

mutBRAF

wtBRAF

grupper, men andelen af ​​kvinder trended mod at blive større i

mutBRAF

gruppe (46% vs. 33% , p = 0,06). Der var ingen signifikante forskelle mellem

mutBRAF

wtBRAF

gruppe for andre karakteristika, herunder etnicitet, personlige, sociale og familiemæssige historie, komplikationer herunder trombose, ascites og pleural effusion (tabel 1).

Patienter, der havde

mutBRAF

tumorer havde mindre hyppig inddragelse af lungerne (60% vs. 79%, p = 0,003), retroperitoneal knuder (11% vs. 25%, p = 0,004 ), og blødt væv (33% vs. 50%, p = 0,01). I undergruppen analyse blev dette mønster også observeret i hver af de tre store tumortyper; men på grund af det lille antal patienter i ikke-melanom kohorte blev signifikans kun opnået for patienter med melanom (ikke viste data). Der var ingen forskel i inddragelse af andre sites med metastaser.

Multivariate Analysis.

I multivariate analyse ved hjælp af en logistisk regressionsmodel, patienter med

mutBRAF

havde mindre hyppige metastaser til (i) blødt væv (OR = 0,39, 95% CI: 0,20-0,77, p = 0,007); (Ii) lunge (OR = 0,38, 95% CI: 0,19-0,73, p = 0,004); og (ii) retroperitoneum (OR = 0,34, 95% CI: 0,13-0,86, p = 0,024) (tabel 2). Kvinder var mere tilbøjelige til at have

mutBRAF end wtBRAF

(OR = 1,92, 95% CI: 1,02-3,57, p = 0,045). Patienter med

mutBRAF

sammenlignet med

wtBRAF

var mere tilbøjelige til at have hjernemetastaser (OR = 2,05, 95% CI: 1,02-4,11, p = 0,043). Patienter yngre end 60 år viste en tendens mod højere sandsynlighed for

BRAF

mutationer (OR = 1,88, 95% CI: 0,99-3,70, p = 0,053). I undergruppe analyse af melanom, denne tendens var statistisk signifikant (multivariat p-værdi = 0,023) (tabel 3). De mindre antal patienter med andre kræftformer udelukket en separat analyse for denne faktor. Et interval fra diagnose til fjernmetastaser på ≥ 2 år var mere tilbøjelige til at være forbundet med

mutBRAF

(Odds ratio (OR) = 2,84, 95% Konfidensinterval (CI): 1,18-4,14, p = 0,013) (tabel 2). Men i sygdomsspecifikke analyser, i tyk- og papillær kræft i skjoldbruskkirtlen, andelen af ​​patienter med en sygdom interval fra diagnose til metastaser af over to år var mindre for patienter med

mutBRAF

sygdom, men det gjorde ikke statistisk signifikans på grund af det lille antal patienter i hver undergruppe (data ikke vist).

Co-Eksisterende Mutationer /Molekylær Afvigelser

En delmængde af

mutBRAF

patienter med tilgængelige data havde også

PTEN

tab (2/7; 29%) eller

PIK3CA

mutationer (1/26; 4%) (tabel 1). Hos patienter med

wtBRAF

, 2/20 (10%) havde

PTEN

tab og 4/46 (9%) havde PIK3CA mutation. Der var ingen forskel i satserne for

PTEN

tab eller

PIK3CA

mutationer mellem

mutBRAF

vs.

wtBRAF

grupper, men det lille antal patienter kan udelukke sikre konklusioner, især i PTEN gruppen.

Som forventet

KRAS

NTM

mutationer var signifikant mindre almindelige i

mutBRAF

gruppen sammenlignet til

wtBRAF

gruppe (

KRAS

: 0/24 (0%) vs. 13/45 (29%), p = 0,002;

NTM

: 1 /17 (6%) vs. 42/108 (39%), p = 0,006). Af interesse, bør det bemærkes, at en patient havde en samtidig

BRAF

de nationale tilsynsmyndigheder

mutation.

BRAF

status og progressionsfri overlevelse ( PFS) på konventionel standardbehandling

Vi analyserede PFS på konventionel behandling (før henvisning til fase 1 klinik) til metastatisk sygdom i henhold til

BRAF

status. Vi valgte de længste PFS hver patient nogensinde havde opnået på en konventionel behandling.

Når analyseret med alle patienter inkluderet, var der ingen generel forskel i median PFS mellem

mutBRAF

vs.

wtBRAF

sygdom (7,0 måneder, 95% CI 5,6-8,3 vs. 7,1 måneder, 95% CI 5,7-8,5; p = 0,49). Men patienter med colorectal cancer og

mutBRAF

havde en median PFS på 7 måneder (95% CI 5,3-8,6) sammenlignet med 9,2 måneder (95% CI 7,4-10,9) i

wtBRAF

( p = 0,002) (figur 1). I multivariat analyse,

mutBRAF

var en uafhængig prognostisk faktor for kortere PFS (HR: 3,76, 95% CI 1,22-11,49, p = 0,02). På den bedste standard systemisk terapi ved metastatisk kolorektal cancer

(En patient med utilstrækkelige optegnelser om tidligere behandling var udelukket).

i melanom og papillær kræft i skjoldbruskkirtlen, var der ingen forskel i median PFS hos patienter med

mutBRAF

forhold til

wtBRAF

(4,3 måneder, 95% CI 1,9-6,8 vs. 5,5 måneder, 95% CI 3,5-6,7; p = 0,29, 24 måneder, 95% CI 14,4-33,5 vs. 25 måneder, 95% CI 0-55,4;. p = 0,65 henholdsvis)

BRAF

status og overlevelse

univariate analyse

Vi analyserede OS fra diagnosetidspunktet og fra. tid af metastase. Den mediane OS fra diagnosetidspunktet for

mutBRAF

patienter var 322 måneder vs 112 måneder (95% CI 58,2 til 165,7) til

wtBRAF

patienter (p = 0,24). Den mediane OS fra tidspunktet for metastase af

mutBRAF

patienter sammenlignet med

wtBRAF

var 99 måneder (95% CI 17,1 til 180,8) vs. 51 måneder (95% CI 38,7-63,2) (p = 0,58).

i sygdom specifik undergruppe analyse, median OS fra diagnose og fra metastaser var numerisk længere melanom patienter med

mutBRAF

forhold til

wtBRAF

(131 måneder 95% CI 52,7 til 209,2 vs. 78 måneder, 95% CI 41,8 til 114,1; p = 0,14 og 35 måneder 95% CI 8,7-61,2 vs. 30 måneder, 95% CI 8,3-53,6; p = 0,63 henholdsvis). I modsætning hertil kolorektal cancer, median OS fra diagnose og fra metastaser var numerisk kortere i

mutBRAF

patienter sammenlignet med

wtBRAF Hotel (48 måneder 95% CI 23,4-72,5 vs. 53 måneder, 95% CI 0 til 125,2; p = 0,22 og 30 måneder, 95% CI 14,5-45,4 vs. 53 måneder, 95% CI 38,8-67,1; p = 0,26 henholdsvis). Lille antal patienter i sygdomsspecifikke undergrupper udelukket mere endelige konklusioner og kan forklare den manglende statistisk signifikans. OS fra diagnosetidspunktet og metastase adskilte sig ikke mellem

mutBRAF

wtBRAF

patienter med papillær kræft i skjoldbruskkirtlen. Den mediane OS fra diagnosetidspunktet blev ikke nået efter en opfølgning på 133 og 138 måneder til

mutBRAF

wtBRAF

hhv. Desuden blev den mediane OS fra metastaser ikke nået med en median opfølgning på 67 og 46 måneder.

Desuden analyserer vi den prognostiske betydning af

NTM

i melanom ved stratificering vores melanom patienter som følger:

mutBRAF

/

wtNRAS

,

wtBRAF /mutNRAS

, og

wtBRAF /wtNRAS

. En median OS fra diagnose i hver af de 3 grupper var 131 måneder (95% CI 81,6 til 180,3) (

mutBRAF

/

wtNRAS

), 67 måneder (95% CI 29-105) (

wtBRAF /mutNRAS

), og 109 måneder (95% CI 51,6 til 166,3) (

wtBRAF /wtNRAS

) .Den OS forskellen mellem

mutBRAF

/vægt

NTM

og

wtBRAF /mutNRAS

var borderline statistisk signifikans (p = 0,05). En median OS fra tidspunktet for metastaser var 35 måneder (95% CI 8,5-61,5), 20 måneder (95% CI 10,3-29,6) og 51 måneder (95% CI 4,8-97,1) (p = 0,45). Disse data tyder på, at patienter med

mutBRAF

melanom overlever længere end dem med

NRAS-

mutant sygdom, men at overlevelsen af ​​

mutBRAF

melanom er ikke forskellig fra melanom patienter med

wtBRAF

wtNRAS

.

multivariat analyse.

En multivariat analyse på alle 229 patienter på baggrund af alder, køn,

RAS Hotel (

KRAS

,

NTM

) mutationer,

BRAF

mutationer, og sygdom typen blev gennemført for at bestemme, om nogen af ​​disse faktorer påvirker overlevelse.

NTM

mutation og mandlige køn var de eneste uafhængige faktorer forbundet med kortere OS fra diagnosetidspunktet (Hazard ratio (HR): 2,52, 95% CI 1,32-4,80, p = 0,005 og HR: 2,84, 95% CI 1,46-5,53, p = 0,002, henholdsvis), mens diagnosen melanom forudsagt en bedre OS fra diagnosetidspunktet (HR: 0,15, 95% CI 0,04-0,58, p = 0,005). Mand køn var den eneste faktor, forudsige dårlig OS fra tidspunktet for metastaser. (HR: 2,79, 95% CI 1,42-5,45, p = 0,003)

En sygdomsspecifikke multivariat analyse, herunder alder, køn,

RAS

(

KRAS

,

NTM

) mutationer og

BRAF

mutationer blev udført. I melanom, kun

NTM

mutation og mandlige køn var forbundet med kortere OS fra diagnosetidspunktet (HR: 2,16, 95% CI 1,11-4,18, p = 0,02 og HR: 2,64, 95% CI 1,28-5,41 , p = 0,008, henholdsvis). Mand køn var den eneste prognostiske faktor for kortere OS fra tidspunktet for metastaser (HR: 2,84, 95% CI 1,35-5,97, p = 0,006). I kolorektal cancer, kun

KRAS

mutation blev identificeret som en selvstændig indikator for dårlig OS fra diagnosetidspunktet og metastase (HR: 13,56, 95% CI 1,61 til 113,88, p = 0,016 og HR: 5,46, 95% CI 1,07-27,89, p = 0,04 henholdsvis). Vi har detekteret også en tendens til,

mutBRAF

at forudsige dårlig OS fra diagnose eller første gang af metastaser (HR: 8,31, 95% CI 0,95-72,56, p = 0,055 og HR: 4,05, 95% CI 0,75-21,76 , p = 0,10, henholdsvis).

i multivariat analyse, blev der ikke prognostisk faktor opdaget for papillær skjoldbruskkirtlen karcinom, måske på grund af det lave antal sager.

Overlevelse i Clinical center for målrettet Terapi (fase i klinik) i henhold til

BRAF

status

Vi udførte en univariate og multivariate analyse til at undersøge de faktorer, der kan forudsige OS fra tidspunktet for forelæggelse for Clinical center for målrettet terapi ( fase i Program) indtil døden i

mutBRAF

patienter. Faktorer inkluderet var: alder (≥60 vs. 60 år, køn (mand vs. kvinde), tumortype, RMH prognostisk score, alder, Eastern Cooperative Oncology Group (ECOG) performance status (0-1 vs. ≥2) behandling med RAF /MEK målrettede midler vs. aldrig behandlet med RAF /MEK målrettet middel, ethvert fald i target læsion størrelse vs. noget fald efter forelæggelse for fase 1-studie.

univariat analyse i

mutBRAF .

patienter

i univariat analyse, vi observerede en længere OS fra henvisning hos kvinder vs. mænd (ikke nået i begge grupper, p = 0,015 og HR 2,62, 95% CI 1,14-6,01; p = 0,02), RMH score på 0-1 vs. 2-3 (ikke nået vs. 5 måneder, 95% CI 3-7; p 0,001 og HR 3,69, 95% CI 1,74-7,82; p = 0,001), performance status ≤1 vs. 2-4 (ikke nået vs. 6 måneder, 95% CI 2,1-9,9; p = 0,035 og HR 2,51, 95% CI 1,01-6,28; p = 0,048), behandling med RAF /MEK målrettede midler (56 af de 80 patienter fik RAF /MEK målretning midler, herunder 37 med melanom, 10 med papillær skjoldbruskkirtlen, 8 med tyktarmskræft og en med kræft i æggestokkene) vs. behandling med andre midler eller ingen behandling (ikke nået vs. 5 måneder, 95% CI 3,4-6,6; p 0,001 og HR 0,20, 95% CI 0,095-0,43; p 0,001), papillær kræft i skjoldbruskkirtlen vs andre kræftformer (ikke nået i begge grupper, p = 0,018 og HR 0,09, 95% CI 0,10 til 0,89; p = 0,04), og en formindskelse af tumorstørrelse på enhver fase I klinisk forsøg vs. noget fald (ikke nået vs. 6 måneder, 95% CI 4,7-7,2; p 0,001 og HR 0,09, 95% CI 0,025-0,32; p 0,001). (Figur 2 og tabel 4)

(patienter, som ikke har tumor målinger på tidspunktet for sidste opfølgning (N = 9) eller patienter, som ikke indgik i et fase 1-studie efter henvisning (N = 13) blev udelukket).

Ved at udelukke patienter, som ikke får indskrevet i en fase 1-studie efter henvisning (13 patienter i alt), fandt vi, at

mutBRAF

patienter behandlet med RAF /MEK målretning agenter har forbedret overlevelse efter henvisning sammenlignet med

mutBRAF

patienter behandlet med andre midler (ikke nået vs 5 måneder, 95% CI 4-6; p = 0,002 og HR 0,26, 95% CI 0,10-0,66; p = 0,005) (figur 3).

skalamærkerne repræsenterer patienterne stadig i live i sidste opfølgning. (Af 80 patienter med

BRAF

mutationer, 56 modtog en RAF /MEK målretning agenter, 11 modtog en ikke målretning agenter RAF /MEK og 13 blev ikke indskrevet på et fase 1-studie).

multivariat analyse i

mutBRAF

patienter.

i multivariat analyse, de to eneste faktorer, der forudsagde en overlegen OS efter forelæggelse for fase i klinik i

mutBRAF

gruppe var behandling med eventuelle RAF /MEK målretning midler (HR 0,16, 95% CI, 0,03-0,89, p = 0,037) og ethvert fald i tumorstørrelse (RECIST måling) på enhver fase i forsøg (HR 0,07, 95% CI, 0,015 -0,35, p = 0,001) (figur 4). Notatet HR værdier af de følgende prædiktive faktorer “melanom vs. non melanom”, “kolorektal cancer vs. ikke kolorektal cancer” og “papillær kræft i skjoldbruskkirtlen vs. ikke papillær kræft i skjoldbruskkirtlen” er ekstremt høj, i forhold til deres HR beregnet af univariate analyse (figur 4). Denne uoverensstemmelse kan forklares med forskellen i anvendte metode. På trods af deres høje absolutte værdier, bør dette fortolkes med forsigtighed, forudsat at de ikke har nogen statistisk signifikans som demonstreret ved en p-værdi tæt på 1 og en 95% konfidensinterval, der indeholder nul. Desuden deres ekstremt bred 95CI% er tegn på dårlig vurdering af deres værdi.

univariat analyse i

wtBRAF

patienter.

En tilsvarende analyse blev gennemført i

wtBRAF

gruppe for de 104 patienter henvist. Univariate analyse viste overlegen OS fra indbringelsen er forbundet med følgende: RMH score på 0-1 i forhold til RMH score på 2-3 (50 måneder, 95% CI 6,4-93,3 vs. 6 måneder, 95% CI 2-10,3; p 0,001 og HR 2,94, 95% CI 1,56-5,56; p = 0,001), behandling med RAF /MEK målrette midler vs. behandling med andre midler eller ingen behandling (51 måneder vs 10 måneder, 95% CI 7,1-12,9; p = 0,014 og HR 0,32, 95% CI 0,12-0,83; p = 0,019), ingen hjernemetastaser vs. hjernemetastaser detekteret (15 måneder, 95% CI 0-34,3 vs. 7 måneder, 95% CI 3-10,3; p = 0,004 og HR 2,47, 95% CI 1,31-4,65; p = 0,005), non melanom vs. melanom (50 måneder vs 10 måneder, 95% CI 6-13,9; p = 0,006 og HR 2,57, 95% CI 1,27-5,18 ; p = 0,008) og en formindskelse af tumorstørrelse vs. noget fald (50 måneder vs 10 måneder, 95% CI 6,2-13,8; p = 0,006 og HR 0,32, 95% CI 0,13-0,75; p = 0,009) (tabel 5).

Ved at udelukke patienter, som ikke får indskrevet i en fase 1-studie efter henvisning (18 patienter i alt), fandt vi, at

wtBRAF

patienter behandlet med RAF /MEK målretning agenter har en tendens til forbedret overlevelse efter henvisning i forhold til

wtBRAF

patienter behandlet med andre midler (51 måneder vs 10 måneder, 95% CI 4,7-15,9; p = 0,052 og HR 0,39, 95% CI 0,14-1,04; p = 0,06)

multivariat analyse i

wtBRAF

patienter.

I den multivariate analyse, ingen af ​​disse faktorer var signifikant associeret med en bedre OS fra henvisning (figur 5) .

Karakteristik af melanom Patienter med

V600K BRAF

mutation

Vi undersøgt yderligere adfærd

mutBRAF

melanom med

V600K

substitution i forhold til andre undertyper af

BRAF

mutation. (Der var 13 patienter med V600K mutationer, herunder 12 med modermærkekræft og én med colorectal cancer). I melanom gruppen, vi sammenlignet patienter med V600K

BRAF

mutationer vs. ikke-V600K

BRAF

mutationer (langt de fleste bliver V600E). Vi fandt, at V600K blev forbundet med mere hjerne (75% vs. 36,3%, p = 0,02) og lungemetastaser (91,6% versus 47,7%, p = 0,007). (Den enkelt patient med kolorektal cancer og V600K havde også hjerne og lungemetastaser). V600K melanomer metastaseret tidligere (median tid til metastase = 19 måneder, 95% CI 0-49 vs. 53 måneder, 95% CI 33-72, p = 0,046), og var forbundet med en kortere OS fra diagnosetidspunktet (median 78 måned, 95% CI 10-146 vs. 322 måneder, p = 0,024) (figur 6).

skalamærkerne repræsenterer patienter, der var i live og censureret på tidspunktet for sidste opfølgning. (En patient, for hvem diagnosetidspunktet var ukendt blev udelukket.)

Vi sammenlignede også OS fra diagnose og fra metastaser mellem V600K melanom vs. wtBRAF melanom, og det var ikke statistisk forskellige (P = 0.53 og 0.54, henholdsvis).

Blandt de 13 patienter med V600K

BRAF

mutation, otte modtog RAF /MEK målrettede midler (hvoraf den ene var colorectal cancer), tre fik ikke behandling ( kun bedste palliativ pleje) og to fik andre målretning agenter. Der var to patienter med stabil sygdom i over fire måneder, men ingen delvise eller komplet remission.

Diskussion

BRAF

er en af ​​de hyppigst muterede protein kinase i kræft [14].