PLoS ONE: Genome Wide Screening for genetiske ændringer i spiserøret Kræft af aCGH Identificerer 11q13 Amplification Onkogener associeret med Nodal Metastase

Abstrakt

Baggrund

E

sophageal pladecellekræft (ESCC) er meget udbredt i Kina og andre asiatiske lande, som en væsentlig årsag til kræft-relaterede dødelighed . ESCC viser komplekse kromosomafvigelser, herunder flere strukturelle og antalsafvigelser. Kromosomafvigelser, såsom tilbagevendende amplifikationer og homozygote sletninger, bidrage direkte til tumorigenese gennem ændring af ekspressionen af ​​vigtige onkogener og tumorsuppressorgener.

Metodologi /Princip Fund

T

o forstå betydningen af ​​genetiske ændringer i ESCC patogenese og identificere kritiske amplifikation /sletning mål, udførte vi hele genomet 1-Mb-array komparativ genomisk hybridisering (aCGH) analyse for 10 almindeligt anvendte ESCC cellelinier. Tilbagevendende kromosomale gevinster blev ofte fundet på 3q26-27, 5p15-14, 8p12, 8p22-24, 11q13, 13q21-31, 18p11 og 20q11-13, med hyppige tab også findes på 8p23-22, 11q22, 14q32 og 18q11-23 . Gevinst på 11q13.3-13.4 var den hyppigste ændring i ESCC. Inden for denne region,

CCND1

onkogen blev identificeret med høj grad af forstærkning og overekspression i ESCC, mens

FGF19

SHANK2

blev også bemærkelsesværdigt overudtrykt. Endvidere er en høj konkordans (91,5%) af genamplifikation og protein overekspression af

CCND1

blev observeret i primære ESCC tumorer.

CCND1

amplifikation /overekspression var også signifikant korreleret med lymfeknude metastaser af ESCC.

Konklusion

Disse resultater tyder på, at genomisk gevinst på 11q13 er den største mekanisme bidrager til amplifikation. Nye onkogener identificeret i 11q13 amplikon herunder

FGF19

SHANK2

kan spille vigtige roller i ESCC tumorigenese

Henvisning:. Ying J, Shan L, Li J, Zhong L Xue L, Zhao H, et al. (2012) Genom-Wide Screening for genetiske ændringer i spiserøret kræft ved aCGH Identificerer 11q13 Amplification Onkogener associeret med Nodal Metastase. PLoS ONE 7 (6): e39797. doi: 10,1371 /journal.pone.0039797

Redaktør: Masaru Katoh, National Cancer Center, Japan

Modtaget: Oktober 6, 2011; Accepteret: 30. maj 2012; Udgivet: 25 juni, 2012