PLoS ONE: Novel DNA Varianter og Mutation Frekvenser af hMLH1 og hMSH2 gener i kolorektal cancer i det nordøstlige Kina Population

Abstrakt

Forskning på

hMLH1

hMSH2

mutationer tendens til at fokusere på Lynch-syndrom (LS) og LS-lignende kolorektal cancer (CRC). Ingen undersøgelser til dato har vurderet rolle

hMLH1

hMSH2

gener i massen sporadisk CRC (uden forvalg af MSI eller tidlig alder debut). Vi havde til formål at identificere roman

hMLH1

hMSH2

DNA varianter, for at bestemme mutationen frekvenser og steder i både sporadisk og LS CRC og deres relationer med klinisk-patologiske karakteristika CRC i nordøstlige Kina. 452 sporadiske og 21 LS CRC patienter blev screenet for germlinie og somatiske mutationer i

hMLH1

hMSH2

gener med PCR-SSCP sekventering. Vi identificerede 11

hMLH1

og syv

hMSH2

DNA-varianter i vores undersøgelse kohorte. Seks af dem var roman: fire i

hMLH1

gen (IVS8-16 A T, c.644 GAT GTT, c.1529 CAG CGG og c.1831 ATT TTT) og to i

hMSH2

gen (-39 C T, indsættelse AACAACA på c.1127 og sletning AAG på c.1129). I sporadisk CRC, kimlinie og somatisk mutation frekvenser af

hMLH1

/

hMSH2

gen var 15,59% og 17,54%, henholdsvis (

s

= 0,52). Kønscellelinie mutationer til stede i

hMLH1

hMSH2

gener var 5,28% og 10,78%, henholdsvis (

s

0,01). Somatiske mutationer i

hMLH1

hMSH2

gener var 6,73% og 11,70%, henholdsvis (

s =

0,02). I LS CRC, både kimcellelinje og somatiske mutation frekvenser af

hMLH1

/

hMSH2

gen var 28,57%. Den mest udbredte kønscellelinie mutation websted i

hMSH2

genet blev c.1168 CTT TTT (3,90%), en polymorfi. Somatisk mutation hyppigheden af ​​

hMLH1

/

hMSH2

gen var signifikant forskellig i proksimal, distal colon og rektal cancer (

s

= 0,03). Vores resultater belyse mutationen spektrum og hyppigheden af ​​

hMLH1

hMSH2

gener i sporadisk og LS CRC, og deres relationer med klinisk-patologiske karakteristika CRC

Citation:. Hu F , Li D, Wang Y, Yao X, Zhang W, Liang, J., et al. (2013) Novel DNA Varianter og Mutation Frekvenser af

hMLH1

hMSH2

Gener i kolorektal cancer i det nordøstlige Kina Befolkning. PLoS ONE 8 (4): e60233. doi: 10,1371 /journal.pone.0060233

Redaktør: Anthony WI. Lo, Den kinesiske University of Hong Kong, Hongkong

Modtaget: Januar 4, 2013; Accepteret: 23 Februar 2013; Udgivet: April 3, 2013 |

Copyright: © 2013 Hu et al. Dette er en åben adgang artiklen distribueres under betingelserne i Creative Commons Attribution License, som tillader ubegrænset brug, distribution og reproduktion i ethvert medie, forudsat den oprindelige forfatter og kilde krediteres

Finansiering:. Dette arbejde blev støttet af tilskud på National Natural Science Foundation of China (nr 30.671.801 og 30.371.243) og instituttet for den returnerede Lærde i Harbin (nr 2005AFLXJ017). De finansieringskilder havde ingen rolle i studie design, indsamling og analyse af data, beslutning om at offentliggøre, eller forberedelse af manuskriptet

Konkurrerende interesser:.. Forfatterne har erklæret, at der ikke findes konkurrerende interesser

Introduktion

Kolorektal cancer (CRC) er en af ​​de mest almindelige maligne sygdomme globalt, og rangerer den femte af alle kræfttilfælde i Kina. WHO anslår, at 220.000 nye CRC tilfælde forekom i Kina i 2008 (GLOBOCAN, 2008). Forekomsten af ​​CRC er steget med 5,73% årligt mellem 1992-2005 (13,06-23,54 /10,0000) i Nangang District, Harbin, Kina [1].

En af de genetiske veje i udvikling af CRC er svigt af DNA mismatch repair (MMR) [2], som bidrager til opretholdelsen af ​​genomisk stabilitet ved at anerkende og fjerne insertion /deletion mutationer, der forekommer under DNA-replikation [3]. De to vigtigste misforhold reparation gener er

hMLH1

hMSH2,

som kortet for at kromosomerne 3p21.3-23 [4] og 2p21-22 [5], hhv.

Siden den første rapport af

hMLH1

hMSH2

genmutationer i Lynch-syndrom (LS) CRC [4], [5], undersøgelser af

hMLH1

hMSH2

genmutationer er blevet offentliggjort. Men de fleste af de offentliggjorte papirer fokuseret på LS eller LS-lignende CRC. I alt 30 små-stikprøvestørrelse (n = 5-61, bortset fra en af ​​315 patienter) undersøgelser er blevet offentliggjort, at screenet germlinie mutationer

hMLH1

hMSH2

gener i sporadisk CRC . Patologiske mutationer af

hMLH1

hMSH2

gener var mere tilbøjelige til at være til stede i yngre patienter [6], og i dem med mikrosatellit instabilitet (MSI). I vores analyse af disse 30 studier, MSI eller tidlig alder debut (under en alder af 40, 45, 50 eller 55 år) blev anvendt til at forudindstille patienter til

hMLH1

hMSH2

gen mutationer i sporadisk CRC. Men ingen Undersøgelsen havde til formål at opdage mutation frekvenser af

hMLH1

hMSH2

gener i massen sporadisk CRC uden MSI eller alder forvalg. I Kina, fire studier (n = 26-58) screenet kimlinie eller somatiske mutationer af

hMLH1

og

hMSH2

gener i sporadisk CRC med forvalg af MSI [7], [8], [ ,,,0],9], [10]. Hvorvidt høje frekvenser af

hMLH1

hMSH2

genmutationer forekommer i sporadisk CRC i Kina er ikke blevet belyst. Endvidere stærke beviser tyder på, at sjældne mutationer af alvorlig effekt er ansvarlige for en væsentlig del af komplekset human cancer [11]. Vi har udført derfor denne undersøgelse for at identificere roman

hMLH1

hMSH2

DNA varianter, til at bestemme både mutationsfrekvenser og steder i både sporadisk og LS CRC og at estimere forholdet mellem kimcellelinje og somatisk mutationer af

hMLH1 /hMSH2

gen og klinisk-patologiske karakteristika CRC i det nordøstlige Kina.

Materialer og metoder

emner

Efter at have opnået informeret samtykke fra forsøgspersoner og godkendelse fra Institutional Research Board of Harbin Medical University, vi identificeret CRC patienter, som gennemgik kirurgi på Cancer Hospital og Anden Tilknyttede Hospital i Harbin Medical University, uden forvalg og baseret på patologisk diagnose alene. Patienter med neuroendokrine karcinom, malignt melanom, non-Hodgkins lymfom, gastrointestinale stromale tumorer, og metastatisk colorectal carcinom blev udelukket fra analysen. Fra 1. juni, 2004 til 15 maj 2005, og maj 15, 2007 til 1. januar 2008 473 primære CRC patienter (452 ​​sporadisk CRC, 21 LS CRC) blev rekrutteret. 457 blodprøver og 356 tumorvæv blev indsamlet for molekylær genetisk analyse.

DNA Extraction

DNA blev succesfuldt udvundet fra alle 457 blodprøver (436 sporadisk CRC og 21 LS CRC) og 356 tumorvæv (342 sporadisk og 14 LS) ved hjælp af klassiske phenol-chloroform procedure [12].

Ved indsamling af blod- og vævsprøver og dna-ekstraktion, vi kunne ikke få tumorvæv DNA af 117 CRC patienter (110 sporadisk og 7 LS) på grund af, at tumorvæv var kun store nok til patologi diagnose eller at vi ikke udtrække DNA med succes. Derfor har vi kun deres blod DNA. I de øvrige 16 sporadiske CRC patienter, opnåede vi parret blod- og vævsprøver. Men i DNA-ekstraktion, vi ikke udtrække DNA succes fra blodprøve. Endelig har 340 CRC patienter (326 sporadisk og 14 LS) parret blod og væv DNA.

Screening for Kimcellelinje og somatiske mutationer af

hMLH1

og

hMSH2

Gener

PCR-SSCP sekventering analyse.

de primere til 20 par alle 19 exons i

hMLH1

gen og 17 par af alle 16 exons i

hMSH2

genet (tabel 1), herunder exon-intron-grænserne blev syntetiseret til genomisk PCR. PCR-amplifikationer blev udført under anvendelse af den følgende protokol i 35 cykler: denaturering i 30 s ved 95 ° C, annealing i 30 sek ved 54 ° C til 64 ° C, forlængelse i 30 sekunder ved 72 ° C, efterfulgt af en endelig forlængelse på 5 min ved 72 ° C (ABI 9700). PCR-produkter blev identificeret ved 1% agarose-elektroforese (Biowest Agarose, Gene Company Ltd).

PCR-produkter blev denatureret ved 98 ° C i 8 min og anbragt på is. Elektroforese blev udført på 8% til 15% ikke-denaturerende polyacrylamidgeler. Efter elektroforese blev geler farvet med sølv (Raffineret Chemical Plant, Shanghai, Kina). 15% af prøverne blev gentaget i detektion af mutationer i hver amplificeret PCR-fragment i PCR-SSCP-analyse, med konkordansen sats i området fra 99,1% til 100% for forskellige amplificerede PCR-fragmenter. Salg

PCR-produkter viser unormal mobilitet under SSCP-analyse blev sendt til sekvens ved hjælp ABI3730XL. Sekventering resultater blev analyseret for genmutationer med kulørtheder 2,22 software (Technelysium Pty. Ltd., QLD, Australien).

Vurdering af Mutation Patogenicitet

For tidligere rapporterede mutationer, resultater af funktion kontrollen blev brugt at bestemme patogenicitet. Hvis ingen funktion kontrol blev rapporteret, var funktion forudsigelse af to af PolyPhen /SIFT /MAPP-MFR resultater bruges til at bestemme deres patogenicitet.

For de nye DNA-varianter, patogenicitet af base substitution i exons blev forudsagt af PolyPhen programmet [13] og MAPP-MMR [14]. Base indsættelse, sletning og substitution i promoter, introns eller 3’UTR blev vurderet af kriterier til bestemmelse af patogenicitet [15]. Vi har detekteret også de nye DNA-varianter i 100 raske kontrolpersoner til bestemmelse af patogenicitet.

Statistisk analyse

Kategori og kontinuerlige variabler blev testet af chi-square test og

t

teste henholdsvis. Alle statistiske analyser blev udført af SAS 9.1 (SAS Institute, Cary, NC, USA).

Resultater

Mutationer

Mutationer i

hMLH1

gen .

Vi identificerede 11 DNA varianter i

hMLH1

gen. IVS8-16 A T, c.1831 ATT TTT og c.1845_1847 sletning GAA var somatiske DNA varianter, andre otte DNA varianter var både kimlinje og somatiske varianter. Fire (IVS8-16 A T, c.704 GAT GTT, c.1529 CAG CGG, c.1831 ATT TTT) var hidtil ukendt DNA-varianter identificeret i sporadiske CRC patienter (figur 1 og tabel 2). Alle fire nye DNA varianter blev ikke påvist i 100 raske kontroller. c.1529 CAG CGG var forudsagt til at have nogen pathogeneity, at pathogeneity andre tre nye DNA varianter var usikre. Syv mutationer (-28 A G, c.927 CCC FTT, IVS13 + 14 G A, IVS14-19 A G, c.1742 CCG . CTG, c.1845_1847 sletning GAA og c * 35_ * 37 sletning CTT) blev tidligere rapporteret i Insight-databasen [10], [16], [17], [18], [19], [20], [21]. c.1742 CCG CTG og c.1845_1847 sletning GAA blev rapporteret til at være patologiske mutationer [21], [22]

Vi identificerede også to polymorfier.. c.655 ATC GTC blev rapporteret at være en fælles polymorfi i kaukasere [23], [24], [25], mens c.1151 GTT GAT blev rapporteret at være mere almindelige i asiatiske befolkning [26]. Derfor har vi ikke kategorisere dem som mutationer i vores undersøgelse.

Mutationer i

hMSH2

gen.

Vi identificerede syv

hMSH2

DNA varianter. Indsættelse AACAACA på c.1127 og sletning AAG på c.1129 var somatiske DNA-varianter, andre seks DNA varianter var både kimcellelinje og somatiske varianter. To DNA-varianter (-39 C T, indsættelse AACAACA på c.1127 og sletning AAG på c.1129) var nyligt påvist i denne undersøgelse (figur 2 og tabel 2). I screening af de to nye DNA varianter i 100 raske kontrolpersoner, der blev ikke konstateret varianter. Den patogenicitet af de to DNA-varianter var usikker. Fem andre mutationer (C.23 ACG ATG, c.471 GGC GGA, c.505 ATA GTA, c.1168 CTT TTT og c.1886 CAA CGA) blev tidligere rapporteret i Insight-databasen [14], [27].

To mandlige patienter foretaget somatiske mutationer i både

hMLH1

og

hMSH2

gener. En anden mandlig patient bar c.1831 ATT TTT mutation af

hMLH1

gen og C.23 ACG . ATG mutation af

hMSH2

gen i både tumorvæv og blod

Mutation frekvenser

Mutation frekvenser i sporadiske CRC patienter.

Blandt 436 sporadiske CRC patienter med tilgængelige blod DNA, kimlinie mutation frekvenser af

hMLH1

hMSH2

gener var 5,28% (23/436) og 10,78% (47/436), henholdsvis (

s

0,01) (tabel 3). Eksklusive synonyme mutationer (c.927 CCC FTT i

hMLH1

c.471 GGC GGA i

hMSH2

) mutationen frekvenser i

hMLH1

hMSH2

gener var 4,59% (20/436) og 8,72% (38/436), henholdsvis (

s =

0,01). Hvis patienten der foretaget to germline mutationer kun blev talt én gang (én patient nærede både -39 C T og C.23 ACG ATG mutationer i

hMSH2

og IVS13 + 14 G En mutation af

hMLH1

, den anden patient udført både c.1831 ATT TTT mutation i

hMLH1

og C.23 ACG ATG i

hMSH2

); derefter 15,59% (68/436) patienter udviste germline mutationer i

hMLH1

/

hMSH2

gen. Patologisk mutation frekvenser af

hMLH1

hMSH2

gener var 0,23% (1/436) og 0%, hhv.

Blandt 342 sporadiske CRC patienter med tilgængelige DNA i tumorvæv, de somatiske mutation frekvenser i

hMLH1

hMSH2

gener var 6,73% (23/342) og 11,70% (40/342), henholdsvis (

s =

0,02) (tabel 3). Eksklusive synonyme mutationer (c.927 CCC FTT i

hMLH1

c.471 GGC GGA i

hMSH2

), mutation frekvenser af

hMLH1

hMSH2

gener var 5,85% (20/342) og 9,94% (34/342), henholdsvis (

s =

0,03). Hvis mutationer blev talt af patienter, i stedet for det faktiske antal mutationer (tre patienter gennemført somatiske mutationer af både

hMLH1

hMSH2

gener), derefter 17,54% (60/342) af patienterne udviste somatiske mutationer af

hMLH1

/

hMSH2

gen. Patologisk mutation frekvenser af

hMLH1

hMSH2

gener var 0,58% (2/342) og 0%, hhv.

Kimcellelinje mutationshyppighed ikke var signifikant forskellig fra somatisk mutation frekvens i

hMLH1

hMSH2

gener, henholdsvis (

s =

0,49 og

s =

0,69, henholdsvis).

mutation frekvenser i LS CRC patienter.

Blandt 21 blod DNA-prøver af LS CRC patienter, en (4,76%) patient foretaget en kimlinie mutation af

hMLH1

og fem (23,81%) patienter gennemført germlinie mutationer i

hMSH2

. Samlet set seks (28,57%) patienter udviste germlinie mutationer af

hMLH1

/

hMSH2

gen.

tumorvæv var kun tilgængelig i 14 LS CRC patienter, en (7,14 %) patient foretaget en somatisk mutation i

hMLH1

og tre (21,43%) patienter foretaget en somatisk mutation i

hMSH2

. I alt fire (28,57%) patienter udviste somatiske mutationer i

hMLH1

/

hMSH2

gen.

Der blev ikke fundet patologiske mutationer i LS CRC patienter.

Den mutation Distribution i forskellige Exoner

Den højeste kimlinie mutation forekomsten af ​​

hMSH2

i sporadisk CRC blev påvist i exon 7 (3,90%), efterfulgt af exon 12 (2,52%), exon 1 (1,38%), og exon 3 (0,46%). Mutationer i disse fire exoner udgjorde 76,6% af de samlede mutationer i

hMSH2

. Så vidt

hMLH1

, mutationsfrekvenser var generelt lavere end i

hMSH2

; de højeste mutationen prævalens var i exon 16, exon 9, exon 13 og exon 19 (0,23%) (tabel 3).

Forholdet mellem Kimcellelinje og somatiske mutationer af

hMLH1 /hMSH2

Gene og klinisk-patologisk Karakteristik af CRC

Somatisk mutation hyppigheden af ​​

hMLH1

/

hMSH2

gen var 22,7% (15/66) i proksimal tyktarmskræft, 17,7% (11 /62) i distal colon cancer og 10,5% (22/209) i endetarmskræft (

s

= 0,03). Betragtninger, kimlinie mutation hyppigheden af ​​

hMLH1

/

hMSH2

gen ikke var signifikant forskellig i proksimal tyktarmskræft (17,3%, 14/81), distal colon cancer (17,8%, 13/73) og endetarmskræft (10,1%, 28/276) (

s

= 0,09). (Tabel 4 og 5).

Kimcellelinje og somatisk mutation hyppigheden af ​​

hMLH1

/

hMSH2

gen ikke var signifikant forskellig i andre klinisk-patologiske karakteristika ( alder, køn, BMI, Dukes stadie, Histotypes, Patologiske typer, Differentieret grad og tumorstørrelse) i CRC.

på grund af færre LS CRC patienter, vi ikke analysere relationerne mellem kimcellelinje og somatiske

hMLH1 /hMSH2

genmutationer og klinisk-patologiske karakteristika LS CRC.

diskussion

Under den formodede model af almindelig sygdom-sjælden variant [28], [29], vi screenede de sjældne varianter af

hMLH1

hMSH2

gener i sporadisk og LS CRC. Vi identificerede 18 typer af DNA-varianter i vores undersøgelse. Seks var hidtil ukendte DNA-varianter og 12 er tidligere blevet beskrevet. Af de seks nye DNA-varianter, fire var i

hMLH1

og to i

hMSH2

.

To af de fire roman

hMLH1

DNA varianter, s .Asp235 Val (c.644 GAT GTT) og p.Gln510Arg (c.1529 CAG CGG), både bly til aminosyre polaritet ændringer, som kan påvirke strukturen af ​​

hMSH2

bindende domæne og

hPMS2 /hPMS1

bindende domæne af

hMLH1

gen henholdsvis og forårsage dysfunktion af DNA MMR-system. En anden DNA varians, p.Ile611Phe (c.1831 ATT TTT), føre til nogen aminosyre polaritet ændringer i

hPMS2 /hPMS1

bindende domæne af

hMLH1

gen produkt, kan have ingen virkning på funktionen af ​​DNA MMR-system [30]. IVS8-16 A T forventes at have nogen effekt på splejsning i exon 9.

En af de to roman

hMSH2

DNA varianter, -39 C T, var en varians i 5 ‘UTR, hvilket kan påvirke mRNA-transkription. Den anden varians, c.1127 ins AACAACA og c.1129 del AAG, var en rammeskiftmutation, som kan påvirke

hMSH6

bindende domæne og

hMutL

homolog interaktion af

hMSH2

genproduktet og forårsage dysfunktion i DNA MMR-system [30].

Selv svigt af DNA MMR-systemet er en af ​​de genetiske pathways i udviklingen af ​​CRC [2]. Ifølge kriterierne for mutation pathogeneity vurdering, en hidtil ukendt DNA variant, c.1529 CAG CGG, blev forudsagt at have nogen pathogeneity, at pathogeneity andre fem nye DNA-varianter var usikre. Derfor kan vi ikke belyse den rolle, som disse nye DNA varianter af

hMLH1

hMSH2

gener i forekomsten og udviklingen af ​​CRC

c.1742 CCG . CTG af

hMLH1

c.1886 CAA CGA af

hMSH2

var grundlægger mutationer i den asiatiske befolkning [31]. Tre andre mutationer af

hMSH2

, C.23 ACG ATG, c.505 ATA GTA og c.1168 CTT TTT, var af højere prævalens i asiater (2,44%, 1,74%, og 6,97%, ) sammenlignet med kaukasiere (0,05%, 0,05% og 0,53% henholdsvis) [31]. Det kan forklare den racemæssige forskel på CRC patienter. Derudover kan det være mere effektivt at opdage disse mutationer i asiatiske befolkningsgrupper

Da vi registreret en højere forekomst af c.1168 CTT . TTT af

hMSH2

i begge LS (14,29%, 3/21) og sporadisk (3,90%, 17/436) CRC, vi screenet for mutationen i raske kontroller. Mutationen frekvens i raske kontroller var 4,16% (21/505), hvilket ikke var signifikant forskellig sammenligne med CRC (

s

= 0,84). Denne særlige mutation blev også rapporteret som en polymorfi i Korea af Kim et al, som ikke påvise en signifikant forskel mellem cases og kontroller [26].

Betydelig Foreningen blev kun observeret mellem somatiske

hMLH1 /hMSH2

genmutationer og tumor placering af sporadisk CRC (

s =

0,03). Den somatiske mutation hyppigheden af ​​

hMLH1 /hMSH2

gen var højest i endetarmskræft, var følgende i proksimale tyktarmskræft, og det laveste var i distal tyktarmskræft. Den ikke-pathogeneity eller usikre pathogeneity kan forklare den ikke-signifikant sammenhæng mellem

hMLH1 /hMSH2

genmutationer og andre klinisk-patologiske kendetegn ved sporadisk CRC.

I vores tidligere metaanalyse baseret på kønscellelinie mutationer af

hMLH1

hMSH2

gener (papir accepteret, 10,1371 /journal.pone.0051240), den poolede patologiske mutation hyppigheden af ​​

hMLH1

var 8,72% (95% CI: 6,12% -12,29%) i sporadisk CRC. Det var 10,28% (95% CI: 4,28-22,70%) i amerikanske undersøgelser, 7,47% (95% CI: 4,06-13,34%) i europæiske studier, og 3,21% (95% CI: 0,88-11,03%) i asiatiske studier (

s =

0,65). I vores kohorte, var det kun 0,23%. Den poolede patologisk mutation hyppigheden af ​​

hMSH2

var 7,28% (95% CI: 5,12% -10,26%) i sporadisk CRC. Det var 5,89% (95% CI: 2,08-15,61%) i amerikanske undersøgelser, 7,58% (95% CI: 4,05-13,76%) i europæiske studier, og 3,64% (95% CI: 1,96-6,65%) i asiatiske studier (

s

= 0,85). Men ingen patologisk mutation af

hMSH2

blev påvist i vores undersøgelse.

Otte [7], [9], [32], [33], [34], [35], [36], [37] og ni undersøgelser [7], [9], [32], [33], [34], [35], [36], [37], [38] i Asien opdaget somatiske mutationer af

hMLH1

hMSH2

gener i sporadisk CRC. Den poolede forekomst af patologiske mutationer var 11,86% (95% CI: 7,62-18,01%) og 7,90% (95% CI: 4,72-12,94%) henholdsvis ved meta-analyse, som er højere end i vores undersøgelse (0,58% og 0%).

Alle de publicerede studier detekteret kimlinie eller somatiske mutationer i sporadisk CRC med forvalg (MSI, tidlig debut alder, eller TGF-p RII mutation) [36], hvilket kunne forklare den højere mutationsfrekvensen i de offentliggjorte enkelte studier og metaanalyser af tidligere publicerede studier. Derudover kan den lille prøvestørrelse i disse publicerede undersøgelser også bidrage til de inkonsistente resultater.

Kun én undersøgelse i Asien opdaget somatiske mutationer af

hMLH1

hMSH2

gener i 31 sporadiske CRC patienter uden forvalg [37]. Den største undersøgelse afsløre kimlinie mutationer var af 315 europæiske BG-CRC patienter under 55 år; mutationen hyppigheden af ​​

hMSH2

blev fundet at være 0,32% (1/325, usikker patogenicitet), mens der ikke mutation i

hMLH1

blev påvist [39].

I vores tidligere metaanalyse, de samlede kimlinie mutation frekvenser af

hMLH1

hMSH2

gener var 28,55% (95% CI: 26,04% -31,19%) og 19,41% (95% CI: 15.88% -23,51%) i Amsterdam-kriterier positive LS CRC. I Amsterdam-kriterier negativ LS CRC, disse samlede mutationsfrekvenser var 16,70% (95% CI: 14,53-19,13%) og 11,13% (95% CI: 9,49-13,42%) for

hMLH1

hMSH2

gener hhv. I vores undersøgelse ingen kimlinie mutation i

hMLH1

exoner blev fundet, ligner en undersøgelse i Japan [40]. Kimcellelinjen mutation hyppighed

hMSH2

var 9,52% (2/21) (eksklusive den polymorfe mutation c.1168 CTT TTT), som var relativt lavere end i meta-analyse (11,13%, 95% CI:. 9,49-13,42%)

Fem asiatiske studier opdaget somatisk mutation af

hMLH1

eller

hMSH2

i LS CRC [7], [41], [42 ], [43], [44]. De samlede somatiske mutation frekvenser i

hMLH1

hMSH2

gener var 9,57% (95% CI: 1,36-44,73%) og 25,65% (95% CI: 10,30-50,89%), henholdsvis på meta-analyse. I vores undersøgelse, det somatisk mutation hyppigheden af ​​

hMSH2

i LS CRC var 14,29% (2/14) (eksklusive den polymorfe mutation, c.1168 CTT TTT). Men ingen somatiske mutationer i

hMLH1

exons blev fundet i LS CRC, svarende til de to japanske undersøgelser [41], [43]. Den somatiske mutation hyppigheden af ​​

hMSH2

i LS CRC varierede fra 5,88% til 58,33% i de fem asiatiske offentliggjorte undersøgelser. En lille prøve størrelse kan forklare variationerne af mutation frekvens i LS CRC.

Som konklusion, vi identificeret seks nye DNA-varianter (fire i

hMLH1

og to i

hMSH2

). I sporadisk CRC, kimlinie og somatisk mutation frekvenser af

hMLH1 /hMSH2

gen var 15,59% og 17,54%, henholdsvis. Forekomsten af ​​kimcellelinje mutationer var 5,28% i

hMLH1

og 10,78% i

hMSH2

. De somatiske mutation frekvenser i

hMLH1

hMSH2

gener var 6,43% og 11,70%, henholdsvis. I LS CRC, både kimcellelinje og somatiske mutation frekvenser af

hMLH1

/

hMSH2

gen var 28,57%. Den mest udbredte kønscellelinie mutation websted i

hMSH2

genet blev c.1168 CTT TTT (3,90%), en polymorfi. Somatisk mutation hyppigheden af ​​

hMLH1

/

hMSH2

gen var signifikant forskellig i proksimal tyktarmskræft, distal tyktarmskræft og endetarmskræft.

Vores resultater kunne bidrage til at belyse den DNA-variant spektrum og hyppigheden af ​​

hMLH1

hMSH2

gener i CRC patienter, især sporadiske CRC patienter i Kina, og deres relationer med klinisk-patologiske karakteristika sporadisk CRC. Funktionelle undersøgelser for at bestemme, hvordan disse nye DNA varianter påvirker protein funktion er påkrævet.

Tak

Tak for den indfødte redigering af den internationale Science redigering.