PLoS ONE: CD24 og APC genetiske polymorfier i pancreascancer som potentielle Biomarkører for Klinisk Outcome

Abstrakt

Baggrund

Der er ingen validerede biomarkører, der korrelerer med prognosen for pancreas duktalt adenokarcinom (PDA ).

CD24

adenomatøs polypose coli (

APC

) gener er vigtige i den maligne transformation af gastrointestinale celler. Denne undersøgelse undersøgte

APC

og

CD24

genetiske polymorfier og deres mulige indvirkning på overlevelsen af ​​patienter med PDA.

Metoder

Kliniske og patologiske data samt som blodprøver til ekstraktion af DNA blev opnået for 73 patienter med PDA. Real-time PCR vurderede genetiske varianter af

APC

(I1307K og E1317Q), og fire forskellige single nukleotid polymorfier (SNPs) i

CD24

gen: C170T (rs52812045), TG1527del (rs3838646) , A1626G (rs1058881) og A1056G (rs1058818).

Resultater

Den mediane alder ved diagnose var 64 (41-90) år. Enogtredive patienter (42,5%) var betjenes, 16 (22%) havde lokalt fremskreden sygdom og 26 (35,5%) havde dissemineret metastatisk cancer. Den malignitet-relateret dødelighed var 84%. Median overlevelse var 14 måneder (11.25-16.74). Overlevelse var ens for vildtype (WT), heterozygote og homozygote varianter af de

APC

eller

CD24

gener. De tre hyppigste

CD24

SNP kombinationer var: heterozygot for A1626G og WT for resten af ​​allelerne (14% af patienterne), heterozygot for C170T, A1626G, A1056G og WT for resten (14% af patienterne ), og heterozygot for C170T, A1056G og WT for resten (10% af patienterne). Alle patienter var APC WT. De to første grupper var signifikant yngre ved diagnose end den tredje gruppe.

Konklusioner

Specifikke polymorfier i

APC

og

CD24

gener kan spille en rolle i pancreas cancerudvikling. Korrelation med overlevelse kræver en større kohorte

Henvisning:. Shamai S, Nabiochtchikov I, Kraus S, Zigdon S, Kazanov D, Itzhak-Klutch M, et al. (2015)

CD24

og

APC

genetiske polymorfier i pancreascancer som potentielle Biomarkører for kliniske resultat. PLoS ONE 10 (9): e0134469. doi: 10,1371 /journal.pone.0134469

Redaktør: Jonathan R. Brody, Thomas Jefferson University, UNITED STATES

Modtaget: Marts 8, 2015; Accepteret: 10. juli 2015; Udgivet: 22 September, 2015

Copyright: © 2015 Shamai et al. Dette er en åben adgang artiklen distribueres under betingelserne i Creative Commons Attribution License, som tillader ubegrænset brug, distribution og reproduktion i ethvert medie, forudsat den oprindelige forfatter og kilde krediteres

Data Tilgængelighed: Alle relevante data er inden for papir og dens Støtte Information filer

Finansiering:.. Finansieret af interne afdelinger midler

konkurrerende interesser:. forfatterne har erklæret, at der ikke findes konkurrerende interesser

Introduktion

Pancreas duktalt adenokarcinom (PDA) er kendt for sin høje dødelighed og triste prognose. Den samlede 5-års overlevelse er 6%. I USA i 2015, vil en anslået 48.960 nye patienter diagnosticeres, og 40,560 patienter vil dø af deres sygdom. [1]. PDA er forårsaget som følge af mutationer i cancerassocierede gener, hvoraf størstedelen er sporadiske, og kun ca. 15% er kimcellelinje mutationer. Sporadiske mutationer påvirker flere vigtige gener. En tidlig debut mutation vises i

K-Ras

onkogen i 90% af tilfældene. Andre typisk berørte gener er tumorsuppressorgener, såsom

TP53

,

CDKN2A

Smad4

med nye kandidatlande førere af bugspytkirtlen carcinogenese nylig identificeret (

KDM6A

og

PREX2

) [2]. Mutationer i moderat penetrerende modtagelighed gener, såsom

BRCA2

,

CDKN2A

, og

MLH1

, tegner sig for 5% af pancreascancer, hvilket tyder på, at meget af den nedarvede risiko for denne sygdom kan skyldes lav penetrans almindelige genetiske varianter [3]. Kemoterapi har ringe succes i tilbagevendende eller dissemineret kræft i bugspytkirtlen. De bedste terapeutiske resultater er opnået med en kombination af tre forskellige kemoterapimidler, hvilket gav en median overlevelse på mindre end et år [4]. Disse tal understreger behovet for yderligere forskning og forståelse af de molekylære veje kørsel denne malignitet.

CD24 er en membran mucin-lignende protein, forankret ved glycosylphosphatidylinositol (GPI), og dens kerne protein er sammensat af 27-31 aminosyrer. Det udtrykkes overvejende på hæmatopoietiske celler, hovedsageligt B-celle prækursorer, celler i centralnervesystemet og epitelceller [5-7]. Den fungerer som et adhæsionsmolekyle, binding til P-selectin på blodplader og endotelceller samt til L1-protein udtrykt på lymfoide og neurale celler [5].

CD24

gen har flere genetiske varianter, der opstår fra enkelte nukleotid polymorfier (SNP). Disse omfatter 170

C → T, en polymorfisme, der fører til en aminosyresubstitution fra alanin til valin, på et sted forbundet til membran forbinder gennem GPI ankeret [8-9]. Tre yderligere SNP’er er placeret i 3′-utranslaterede region, og de omfatter 1626

A → G, 1056

A → G og 1527

tgde, hvilket kan påvirke

CD24

mRNA stabilitet .

Tidligere undersøgelser har vist, at CD24 er en markør for en række cancer stamceller, herunder pancreascancer [10]. Ændringer i CD24-ekspression i cancer-cellelinjer kan ændre cellulære egenskaber og tumorvækst. Vi havde tidligere vist, at behandling af pancreas og tyktarmskræft cellelinjer med anti-CD24 monoklonale antistoffer (MAB) eller CD24 nedregulering bruger korte hårnål (sh) RNA effektivt hæmmede celledeling

in vitro

og retarderede tumorigenicitet i xenotransplanteret nøgen mus [11]. Rolle

CD24

i PDA er stadig uklart. Det har været forbundet med dårlig differentiering, men ikke til overlevelse [12]

tumorsuppressorgen,

APC

(adenomatøs polypose coli), er blevet grundigt undersøgt og knyttet til colorektal cancer udvikling [ ,,,0],13,14]. Laken et al. rapporterede en kimcellelinje missense mutation, der forårsagede udskiftningen af ​​T til A ved nukleotid 3977, hvilket førte til indsættelsen af ​​lysin (K) i stedet for isoleucin (I) ved kodon 1307 (I1307K). Dette menes at forårsage ustabilitet, hvilket muligvis bidrager til malign transformation [15]. En anden polymorfi,

APC

E1317Q variant, er en substitution af glutaminsyre (E) for glutamin (Q) ved codon 1317 (E1317Q). Dette resulterer fra en G til C substitution i nukleotid 4006 og kan være forbundet med kræft udvikling [16].

rolle

APC

i PDA er ikke klart. Det er blevet vist, at pancreas tumorer ikke har udviklet følgende betingede inaktivering af

APC

i bugspytkirtlen, hvilket antyder, at

APC

er påkrævet for tumorigenese i bugspytkirtlen [17]. En tidligere undersøgelse, der undersøgte

APC

E1317Q og I1307 i PDA fundet nogen forening i en kohorte af 58 patienter [16]. Den aktuelle undersøgelse havde til formål at undersøge en mulig sammenhæng mellem det kliniske forløb af PDA og genetiske ændringer i

CD24

APC

gener.

Materialer og Metoder

Deltagere

nydiagnosticerede patienter med PDA, der blev behandlet på Institut for Onkologi ved Tel Aviv Sourasky Medical center, Tel Aviv, Israel, mellem 2000-2014, blev prospektivt rekrutteret til undersøgelsen. Efter opnåelse af skriftligt informeret samtykke blev blodprøver udtaget til analyse og genotypning af

CD24

APC

SNPs. Patientens filer blev retrospektivt set, og kliniske og patologiske data blev indsamlet, herunder demografi, sygdom fase, behandling, respons på kemoterapi og overlevelse. Forsøget blev godkendt af den lokale Institutional Review Board (IRB, Sourasky lægecenter Helsinky udvalg) og den israelske sundhedsministerium (Helsinky godkendelsesnummer 02-130, israelske sundhedsministerium ansøgning 919.990.171).

Genetic Analysis

Assay metoder.

Blod blev opsamlet i rør indeholdende EDTA. Perifere blodleukocytter (PBL’er) blev isoleret fra fuldblodsprøver ved at indsamle hvide fibrinlag opnået efter blod centrifugering i 3 minutter ved 4 ° C ved 3000 rpm og bortkastning af plasma supernatant.

DNA Ekstraktion

Genomisk DNA blev ekstraheret fra PBL’er ved standardmetoder som beskrevet af Miller et al. [18].

Bestemmelse af de forskellige

CD24

polymorfier

Real-time PCR (qPCR) blev anvendt til at genotype rs8734 (C170T), rs3838646 (TG1527del), rs1058881 (A1626G), og rs1058818 (A1056G)

CD24

polymorfier ved hjælp af brugerdefinerede TaqMan SNP genotypning Analyser forhåndsudformede af Applied Biosystems (Applied Biosystems, Foster City, CA, USA), efter de tekniske procedurer anbefalet af producenten. Assay-reagenser til SNP genotyping fra Assays-by-design bestod af en 40X blanding af umærkede PCR-primere og TaqMan MGB prober (FAM og VIC dye-mærket). Disse assays blev designet til genotypebestemmelse af de specifikke SNPs. Følgende primersekvenser blev anvendt:

For rs8734 polymorfi: fremad primer, GGTTGGCCCCAAATCCA; revers primer, GACCACGAAGAGACTGGCTGTT; allel 1 (VIC), CACCAAGGCGGCT; allel 2 (FAM), CACCAAGGTGGCTG

For rs1058818 polymorfi:. fremad primer, AGCTAAACGGATTCCAAAGAGTAGAA; revers primer, TGGGCGACAAAGTGAGACTGT; allel 1 (VIC), TGCATTGACCACGACT; allel 2 (FAM), TGCATTGACCGCGAC

For rs3838646 og rs1058881 polymorfier:.. Assay ID AH0JB89 og Assay ID AH1SAFH henholdsvis (Applied Biosystems)

Betingelserne for PCR-amplifikation var identiske. PCR-reaktionerne blev udført i et 10 pi volumen indeholdende 20 ng genomisk DNA og fremstillet ved anvendelse af TaqMan Universal PCR Master Mix komponenter (Applied Biosystems), som indeholdt nukleotider, buffer, uracil-N-glycosylase, AmpliTaq, og en passiv henvisning farvestof (ROX). Reaktionsblandingen indeholdt 5.0μl af TaqMan Universal PCR Master Mix, 2.75μl af H

2O, 0.25μl af assaykomponenterne (primersæt og probe specifik for hver polymorfisme), og 2.0μl af DNA fra hver prøve. En trin One Plus Real-Time PCR System (Applied Biosystems) blev anvendt til at udføre de qPCR forsøg ved anvendelse af følgende cyklus-forløb. Den cykliske blev initieret ved forvarmning ved 600 ° C i 30 sekunder og 950 ° C i 10 minutter, efterfulgt af 40 cykler af 920 ° C i 15 sekunder, 600 ° C i 1 minut og 600 ° C i 30 sekunder. Den Stepone v2.2 (Applied Biosystems) program blev anvendt til at fortolke reaktionen resultater, ved hjælp af den grafiske repræsentation af VIC og FAM fluoroforen emissioner med hensyn til konstitutive ROX emissioner.

Vurdering af I1307K Polymorfi på

APC

Gene

Genomisk DNA blev amplificeret ved PCR under anvendelse af en fremadrettet primer (5 ‘-GAAATAGGATGTAATCAGACG – 3’) og en revers primer (5 ‘-AGTCTGCTGGATTTGGTTCTA – 3’). Til tidstro-PCR, blev en sensor primer designet efter vildtype (WT) allel og nedstrøms til det som et anker primer. Til påvisning af den specifikke polymorfe nukleotid (T /A ved position 3977 af SEQ ID NO: 7), ankeret primer var: LC-Red 640- TTTGCAGGGTATTAGCAGAATCTGCTTCCTGTG-ph (SEQ ID NO: 9) og sensoren primer var: CCAATCTTTTCTTTTTTTTCTGC -FL (SEQ ID NR: 10)

Vurdering af E1317Q Polymorfi på

APC

Gene

Genomisk DNA blev opformeret ved PCR ved hjælp af en forward primer (5′. GAAATAGGATGTAATCAGACG- 3 ‘) og en revers primer (5′-CACCACTTTTGGAGGGAGA- 3’). Primere og detektion af den specifikke polymorfe nukleotid (G /C ved position 4006 af SEQ ID NO: 7) blev ved real-time PCR under anvendelse af anker-primeren: TGCTGTGACACTGCTGGAACTTCGC-FL (SEQ ID NO: 11) og sensor primer (ph-LC -Red705-CACAGGATCTTGAGCTGACCTAG (SEQ ID NO: 12).

Statistisk analyse

Beskrivende statistiske værdier for alle variabler blev beregnet for hele studiepopulationen Disse omfattede median, range, frekvenser og relativ. frekvenser der er relevant i henhold til variabel type. de relative frekvenser af hvert gen permutation (kombination) blev beregnet, og de tre hyppigste permutationer blev yderligere analyseret. Beskrivende statistik blev beregnet for hver permutationsgruppe. Forskelle i kategoriske variable mellem de forskellige permutation grupper var analyseret ved hjælp af Chi-squared test af uafhængighed. Forskelle i demografiske kvantitative variabler blev analyseret ved ikke-parametrisk ANOVA med Kruskal-Wallis test (for omnibus tests) og yderligere med Wilcoxon rank-sum test, hvis sammenligninger par blev indikeret af den tidligere. Forskelle i overlevelseskurver blev analyseret under anvendelse af log-rank test. En

s

-værdi 0,05 blev betragtet som statistisk signifikant. Hvis det er relevant, tests var to-sidet og justeret for multipel sammenligning. Alle statistiske analyser blev udført ved anvendelse af SPSS 22 (IBM Corporation Inc., USA).

En magt analyse for log rank test var baseret ona 2-sidet alfa på 0,05. Den genotyper Forholdet var baseret på tidligere undersøgelser, (19,20). Wt gruppe blev taget som reference, med en formodet overlevelse på 12 måneder for den undersøgte population (behandlet i bugspytkirtlen cancerpatienter) og sammenlignet med ikke-wt genotyper. Strøm til symmetrisk forskel i overlevelse (dvs. vægt lige så sandsynligt, at være bedre eller værre end sammenligningsgruppen) blev beregnet på grund af den sonderende karakter af denne undersøgelse, med en klinisk signifikant forskel defineret som 4 måneder (S1 data)

Resultater

kliniske Karakteristik af de patienter

de registreringer af 73 PDA patienter, der var blevet behandlet på vores institution mellem 2000-2014 var tilgængelige for både genetiske og kliniske vurderinger (tabel 1). De omfattede 38 (52%) mænd og 35 (48%) kvinder med en gennemsnitsalder på 64 år (41-90). Ti patienter (14%) havde tidligere malignitet med ingen tilbagevendende mønster. Ved diagnose, 31 (42,5%) patienter var operabel, havde 16 (21,9%), lokalt fremskreden inoperabel sygdom, og 26 (35,6%) havde metastatisk kræft. Tredive-fire patienter opereret med helbredende hensigt: 22 havde Whipple procedure, ni havde en distal pankreatektomi og tre havde en samlet pankreatektomi. Tyve-seks patienter (76,5%) havde R0 resektion og otte patienter (23,5%) havde R1 resektion. Af de fire og tredive patienter, som blev drevet, sytten (50%) havde ingen lymfeknudeinvolvering, mens sytten (50%) havde patologiske lymfeknuder [median: 1, interval (1-13)]. Tretten af ​​de 16 patienter (81%), som lokalt har rejst, inoperabel sygdom modtog neoadjuverende kemoterapi, mest almindeligt gemcitabin og cisplatin, og ni modtog strålebehandling, med sideløbende ugentlig cisplatin. På tidspunktet for sidste vurdering, 13 i 73-patient kohorte (17,8%) forblev fri for sygdom, 56 (76,7%) havde dissemineret sygdom, og 4 (5,5%) var tabt for opfølgning.

De patienter, der havde metastatisk sygdom modtaget en median på én behandling linje (0-5). Den mest almindelige første behandlingsmulighed var gemcitabin-baserede dublet (16/56, 28%), et klinisk forsøg (14/56, 25%) eller den bedste understøttende behandling alene (16/56, 28%). Blandt de fyrre patienter, der fik kemoterapi, svarprocenten på den første linje var 22% (ni patienter), mens 30% (tolv patienter) havde stabil sygdom, 35% (fjorten patienter) havde sygdomsprogression, og 12,5% (fem patienter ) havde manglende data. Den mediane samlede overlevelse for hele kohorten var 14 måneder (11.25-16.74). Omsider opfølgning, 61 patienter (83,6%) døde af deres sygdom, tre (4%) døde af uafhængige årsager, tre (4%) var i live med sygdom, og fem (6,8%) var i live uden sygdom. Kun én patient var tabt for opfølgning. Den mediane opfølgning var 85,7 måneder (16,8 til 158,4).

Fuld kliniske karakteristika i henhold til de forskellige SNP’er præsenteres (S2 data for APC I1307K, S3 Data til APC E1317Q, S4 Data til CD24 C170T, S5 data for CD24 Tgdel, S6 data til CD24 A1056G, S7 data for CD24 A1626G).

APC

Forekomst og overlevelsesdata

APC

I1307K og E1317Q polymorfismer blev identificeret i 11 (15%), og en (1,5%) patienter. Alle luftfartsselskaber i denne kohorte var heterozygoter i

APC

polymorfier. Der var ingen statistisk signifikant forskel i overlevelse mellem bærere af de forskellige

APC

polymorfier og ikke-bærere. Den mediane overlevelse af patienter med WT

APC

I1307K var 14 måneder, i modsætning til en median på otte måneder i den heterozygote gruppen (fig 1). Men forskellen var ikke signifikant (

s

= 0,528). Kun én patient var heterozygot for

APC

E1317Q polymorfi, udelukker påvisning af en overlevelse forskel. Interessant, at patienten overlevede meget længere end medianen, dvs 28 måneder.

CD24

incidens og overlevelsesdata.

CD24

polymorfi 170

C → T blev identificeret i 29 (39,7%) heterozygote patienter og fire (5,5%) af homozygote patienter. Den 1527

tgdel

CD24

variant var til stede i syv (9,6%) heterozygote patienter og én (1,4%) homozygot patient.

CD24

polymorfi 1056

A → G blev identificeret i 50 patienter, 34 (46,6%) af dem var heterozygoter og 16 (21,9%) var homozygote. Den sidste

CD24

variant, 1626

A → G, var til stede i 52 (71,2%) heterozygote patienter og to (2,7%) homozygote patienter (tabel 2). Der var ingen statistisk signifikant forskel i overlevelse mellem bærere af de forskellige

CD24

polymorfier og ikke-bærere.

Den mediane samlede overlevelse (MOS) på

CD24

polymorfi 170

C → T heterozygote og homozygote var 13 og 14 måneder, sammenlignet med 14 måneder for WT-gruppen (

s

= 0,722, fig 2A). Mos i 1527

tgdel variant var 13 måneder for WT-gruppen, 21 måneder for de heterozygote patienter, og 42 måneder for den enkelte homozygote patient (

s

= 0,494, Fig 2B). De 34 patienter, der var heterozygote for

CD24

1056

A → G polymorfisme havde en MOS på 12 måneder, i modsætning til 15 måneder i WT-gruppen og 16 måneder for homozygote patienter (

s

= 0,685, fig 2C). Den sidste gruppe, der skal testes, dem med de 1626

A → G variant, heller ikke vise nogen overlevelse forskelle i forhold til MOS på 15, 13 og 16 måneder i WT, heterozygote og homozygote patienter henholdsvis (

s

= 0,834, fig 2D).

A. For

CD24

170

C → T polymorfi. B For

CD24

1527

tgdel polymorfi. C Til

CD24

1056

A → G polymorfi. D For

CD24

1626

A → G polymorfisme.

Genetiske Permutationer

Vi identificerede tre genotyper, som gik igen i vores kohorte med høj forekomst. Genotype 1 (10/73 patienter, 14% af kohorten) var WT til alle seks testede polymorfier, med undtagelse af

CD24

1626

A → G heterozygoti. Genotype 2 (10/73 patienter, 14%) var WT til både

APC

varianter og

CD24

1527

tgdel, og heterozygote til de resterende tre

CD24

polymorfier. Den tredje gruppe, genotype 3 (9/73 patienter, 10%) var heterozygote til

CD24

170

C → T og 1056

A → G polymorfier og WT til resten. Der var ingen statistisk forskel i overlevelse mellem de patienter med de tre forskellige genotyper og resten af ​​kohorten (

s

= 0,440). På tidspunktet for diagnosen, median alder 73 patienter var 64 år, og der var ingen statistisk signifikant forskel mellem de forskellige

APC

og

CD24

polymorfier blandt dem. Men ved vurderingen af ​​de tre dominerende genotyper, alder ved diagnose var 58,5 år for genotype 1, 60 år for genotype 2 og 74 år for genotype 3, hvilket var statistisk signifikant i forhold til resten af ​​kohorten (

p

= 0,041, figur 3). Sammenligning af yderligere kliniske karakteristika, såsom reaktion på første linje kemoterapi (

s

= 0,27), tid indtil sygdomsprogression (

s

= 0,536) og tumor bedømmelse (

p

= 0,782) viste, at ingen var signifikant forskellig mellem grupperne.

Alder forskelle mellem patienter med tre fremherskende genotyper og resten af ​​kohorten.

diskussion

Ektopisk ekspression af CD24 i tumorceller forøger proliferation, fremmer tumor celleadhæsion til fibronectin, laminin og kollagen i, IV (samt P-selectin), og bidrager til større cellemotilitet og invasivitet [5, 21]. Fremskridt i nyere forskning har knyttet CD24 til progression og malignitet af flere epiteliale og hæmatopoietiske tumorer. Høj ekspression af dette protein blev rapporteret som værende en uafhængig forudsiger af ringe overlevelse i lungekræft [22-23]. Cytoplasmatisk farvning for CD24 protein var fraværende i normal epitel i kræft i æggestokkene, og til stede i æggestokkene adenocarcinom, og dets overekspression blev uafhængigt knyttet til en dårligere overlevelse [24-25]. Den samme korrelation blev demonstreret i bryst- [26] og prostatacancer [27-28].

CD24 spiller en vigtig rolle onkogen i gastrointestinale tumorer. Dets overekspression blev uafhængigt knyttet til dårlig prognose i esophageal cancer [29-30]. Positiv immunhistokemisk farvning for cytoplasmatisk CD24 var relateret til mere forhånd iscenesættelse hos patienter med mavekræft [31]. En nylig undersøgelse viste, at colon mucosa har en forøget ekspression af CD24, selv på et tidligt stadium af malign transformation [21]. CD24 overekspression var korreleret til nedsat overlevelse i kolorektal cancer [32]. Sagiv et al. demonstreret en rolle CD24 i carcinogene proces i pancreascancer [33]. I deres undersøgelse blev humane Colo357 pancreas adenocarcinom celler behandlet

in vitro

med anti-CD24 mAB’er, hvilket resulterede i anholdelsen af ​​cellevækst i en dosis- og tidsafhængig måde, mens cellerne negative for CD24-ekspression blev ikke påvirket i samme grad. Anti-CD24 Mab’er også effektiv til reduktion af tumorvækst af bxpc3 bugspytkirtelkræft xenotransplantater i mus [34]. Pancreas og colon adenocarcinom celler behandlet

in vitro

med shRNA sigende nedreguleret

CD24

udtryk og havde svækket cellevækst og motilitet [11]. Den aktuelle undersøgelse søgte en sammenhæng mellem fire forskellige

CD24

SNPs, to

APC

genetiske varianter, og det kliniske forløb af kræft i bugspytkirtlen. Så vidt vi ved, er dette den første rapport om en undersøgelse af disse foreninger. Der var ingen forskel i overlevelse heterozygote og homozygote patienter, muligvis på grund af den relativt lille størrelse af kohorten. Desuden alder ved diagnose, respons på behandling, og tid indtil sygdomsprogression syntes også at have nogen prognostisk værdi i denne indstilling.

Forekomsten af ​​de fire forskellige

CD24

SNPs i vores patientpopulation svarede til forekomsten blandt de raske beskrevet af vores gruppe i en tidligere arbejde [19], med den eneste væsentlige undtagelse er blevet fundet i forekomsten af ​​

CD24

1626

A → G: 29% af de raske kontroller i denne undersøgelse var heterozygote, sammenlignet med 71,2% af PDA patienterne i det aktuelle arbejde.

Vi havde undersøgt forekomsten af ​​

APC

polymorfier I1307K og E1317Q hos raske forsøgspersoner i tidligere [20]. Forekomsten af ​​E1317Q variant var 1,2% (tolv forsøgspersoner ud af 1.000 screenede), som er magen til vores nuværende resultat på 1,4% i PDA patienter. Den I1307K variant, dog blev identificeret i kun 5,3% raske forsøgspersoner sammenlignet med 15% i PDA-patienter.

Interessant, ud af mange forskellige genotype permutationer, tre stod som værende fremherskende i 14%, 14 % og 10% af patienterne. To af de tre genotyper, heterozygositet til

CD24

1626

A → G (WT til resten), og heterozygositet til

CD24

170

C → T, 1626

a → G, 1527

tgdel (WT til resten) blev diagnosticeret på et betydeligt yngre alder end resten af ​​gruppen (median på 58,5 og 60 år sammenlignet med 64 år, henholdsvis). Den tredje genotype, den ene med heterozygositet til

CD24

170

C → T og 1056

A → G og WT til resten, blev diagnosticeret på et langt højere alder (74 år).

Konklusion

Selvom vi var ude af stand til at opdage eventuelle virkninger af

APC

og

CD24

gener på overlevelse hos patienter med PDA, oplysningerne her garanterer yderligere studere med hensyn til deres rolle i bugspytkirtlen carcinogenese og prognose, og i en større kohorte.

Støtte Information

S1 data. Statistiske beregninger, sammen med de faktiske stikprøvestørrelser pr SNP

doi:. 10,1371 /journal.pone.0134469.s001

(TIF)

S2 data. Tumor fase, kvalitet og beliggenhed for APC I1307K polymorfi

doi:. 10,1371 /journal.pone.0134469.s002

(TIF)

S3 data. Tumor fase, kvalitet og beliggenhed for APC E1317Q polymorfi

doi:. 10,1371 /journal.pone.0134469.s003

(TIF)

S4 data. Tumor fase, kvalitet og beliggenhed for CD24 C170T polymorfi

doi:. 10,1371 /journal.pone.0134469.s004

(TIF)

S5 data. Tumor fase, kvalitet og beliggenhed for CD24 Tgdel polymorfi

doi:. 10,1371 /journal.pone.0134469.s005

(TIF)

S6 data. Tumor fase, kvalitet og beliggenhed for CD24 A1056G polymorfi

doi:. 10,1371 /journal.pone.0134469.s006

(TIF)

S7 data. Tumor fase, kvalitet og beliggenhed for CD24 A1626G polymorfi

doi:. 10,1371 /journal.pone.0134469.s007

(TIF)

Tak

Esther Eshkol er takkede for redaktionelle assistance.