PLoS ONE: ARLTS1 og Prostata Cancer Risk – Analyse af Expression og forordning

Abstrakt

Prostatakræft (PCA) er en heterogen træk for hvor flere modtagelighed loci har været impliceret af genom-dækkende kobling og association studier. Det genomiske region 13q14 ofte udgår i tumorvæv både sporadiske og familiære PCA patienter og følgelig anerkendes som en mulig locus tumorsuppressorgen (s). Deletioner af denne region er blevet fundet i mange andre cancerformer. For nylig viste vi, at homozygote bærere til T442C variant af

ARLTS1

gen (ADP-ribosylering faktor-lignende tumorsuppressorprotein 1 eller

ARL11

, placeret på 13q14) er forbundet med en øget risiko for både umarkeret og familiær PCa. Endvidere blev varianten T442C observeret i større hyppighed blandt ondartet vævsprøver, PCA cellelinjer og xenografter, støtter sin rolle i PCa tumorudvikling. I denne undersøgelse blev 84 PCA tilfælde og 15 kontroller analyseret for

ARLTS1

ekspressionsstatus i blod-afledt RNA. En statistisk signifikant (p = 0,0037) fald på

blev opdaget ARLTS1

udtryk i PCA tilfælde. Regulering af

ARLTS1

udtryk blev analyseret med eQTL (udtryk kvantitativ trait loci) metoder. I alt fjorten væsentlig

cis

-eQTLs påvirker

ARLTS1

udtryk niveau blev fundet. Desuden epistatisk interaktioner af

ARLTS1

genomiske varianter med gener involveret i immunsystemet processer blev forudsagt med MDR-programmet. Afslutningsvis denne undersøgelse støtter yderligere rolle

ARLTS1

som et tumorsuppressorgen og afslører, at udtrykket er reguleret gennem varianter lokaliseret i regulatoriske regioner

Henvisning:. Siltanen S, Fischer D, Rantapero T, Laitinen V, Mpindi JP, Kallioniemi O, et al. (2013)

ARLTS1

og Prostata Cancer Risk – Analyse af Expression og forordning. PLoS ONE 8 (8): e72040. doi: 10,1371 /journal.pone.0072040

Redaktør: Amanda Ewart Toland, Ohio State University Medical Center, USA

Modtaget: April 4, 2013; Accepteret: 3 juli 2013; Udgivet: August 5, 2013