PLoS ONE: Rettelse: Identifikation af Druggable Cancer driverindstillinger Gener Amplified tværs TCGA Datasets

Indkaldelse til Genudsendelse

Denne artikel blev genudgivet den 18. august 2014, fordi to af de 16 datasæt fra TCGA (The Cancer Genome Atlas) inkluderet i denne undersøgelse, dvs. Livmoderhalskræft (moratorium – september 27, 2014) og Pancreas ductal adenocarcinom (moratorium – juli 30, 2015), blev anvendt i strid med retningslinjerne Offentliggørelse på https://cancergenome.nih.gov/publications /publicationguidelines

forfatterne og TCGA enige om, at en genudgivelse af artiklen med disse datasæt fjernet ville løse dette, og personalet Academic Editor og PLoS er tilfredse, at resultaterne og konklusionerne af artiklen stå uden disse to datasæt. Vi genudgiver artiklen for at rapportere de opnåede resultater fra de 14 tilladte datasæt

resumé af resultaterne i det abstrakte var tidligere:.

Vi udførte GISTIC2 analyse af TCGA datasæt spænder 16 cancer undertyper og identificeret 486 gener, som blev amplificeret i to eller flere datasæt. Listen blev indsnævret til 75 cancer-associerede gener med potentielle “druggable” egenskaber. Størstedelen af ​​gener blev lokaliseret til 14 amplikoner spredt over hele genomet. For at identificere potentielle kræft driver gener, analyserede vi gen kopi nummer og mRNA udtryk data fra individuelle patientprøver og identificeret 42 formodede kræft driver gener forbundet med diverse onkogene processer

resumé af resultaterne i det abstrakte er nu.:

Vi udførte GISTIC2 analyse af TCGA datasæt spænder 14 cancer undertyper og identificeret 461 gener, der blev forstærket i to eller flere datasæt. Listen blev indsnævret til 73 cancer-associerede gener med potentielle “druggable” egenskaber. Størstedelen af ​​gener blev lokaliseret til 13 amplikoner spredt over hele genomet. For at identificere potentielle kræft driver gener, analyserede vi gen kopi nummer og mRNA udtryk data fra individuelle patientprøver og identificeret 40 formodede kræft driver gener forbundet med diverse onkogene processer.

Reference

en. Chen Y, McGee J Chen X, Doman TN, Gong X, et al. (2014) Identifikation af Druggable Cancer drivere Gener Amplified tværs TCGA datasæt. PLoS ONE 9 (5): e98293 doi: 10,1371 /journal.pone.0098293.

Vis artikel

PubMed /NCBI

Google Scholar Vejviser

Henvisning:

PLoS ONE

Staff ( 2014) Korrektion: Identifikation af Druggable Cancer drivere Gener Amplified tværs TCGA datasæt. PLoS ONE 9 (9): e107646. doi: 10,1371 /journal.pone.0107646

Udgivet 2. september, 2014

Copyright: © 2014 PLoS ONE Staff. Dette er en åben adgang artiklen distribueres under betingelserne i Creative Commons Attribution License, som tillader ubegrænset brug, distribution og reproduktion i ethvert medie, forudsat den oprindelige forfatter og kilde er krediteret.