PLoS ONE: PSCA rs2294008 Polymorfi med øget risiko for Cancer

Abstrakt

Baggrund

Offentliggjorte data om sammenhængen mellem

PSCA

rs2294008 polymorfi og kræftrisiko har impliceret overbevisende resultater . For at bestemme forholdet og præcist vurdere estimatet af foreningen effekt størrelse, vi foretaget en meta-analyse.

Metoder

Vi søgte offentliggjort litteratur i Embase og PubMed databaser bruger søgeordene ”

PSCA

“,” prostata stamcelle antigen “,” varianter “,” polymorfi “,” polymorfismer “, og” kræft “. I alt 21 støtteberettigede artikler blev hentet med 27, 197 kræfttilfælde og 48, 237 kontroller.

Resultater

På hele, fandt vi sammenhængen mellem

PSCA

rs2294008 polymorfi og kræftrisiko var statistisk signifikant: TT vs CC: OR = 1,18, 95% CI, 1,10-1,27; TT + CT vs CC: OR = 1,08, 95% CI, 1,05-1,10; TT vs CT + CC: OR = 1,14, 95% CI, 1,07-1,21; T vs C: OR = 1,10, 95% CI, 1,06-1,14; CT vs CC: OR = 1,10, 95% CI, 1,06-1,13. Stratificerede analyser kræft type og etnicitet viste lignende resultater.

Konklusioner

På baggrund af den statistiske beviser, vi kan drage en konklusion, at rs2294008 polymorfi af PSCA gen vil kunne spille en rolle i kræft carcinogenese, især i gastrisk kræft og blærekræft

Henvisning:. Geng P, Li J, Wang N, Ou J, Xie G, Liu C, et al. (2015) PSCA rs2294008 Polymorfi med øget risiko for kræft. PLoS ONE 10 (8): e0136269. doi: 10,1371 /journal.pone.0136269

Redaktør: Masaru Katoh, National Cancer Center, JAPAN

Modtaget: Marts 5, 2014 Accepteret: August 3, 2015; Udgivet: 26 August, 2015

Copyright: © 2015 Geng et al. Dette er en åben adgang artiklen distribueres under betingelserne i Creative Commons Attribution License, som tillader ubegrænset brug, distribution og reproduktion i ethvert medie, forudsat den oprindelige forfatter og kilde krediteres

Finansiering: Dette arbejde blev støttet ved tilskud nummer 81272364 fra National Natural Science Foundation of China (til HJL). De finansieringskilder havde ingen rolle i studie design, indsamling og analyse af data, beslutning om at offentliggøre, eller forberedelse af manuskriptet

Konkurrerende interesser:.. Forfatterne har erklæret, at der ikke findes konkurrerende interesser

Introduktion

genom-dækkende forening undersøgelser (GWAS) vedrørende ætiologi for kræft har etableret mere end 150 regioner i forbindelse med forskellige specifikke kræftformer. Opdagelserne held udvide den nuværende forståelse af carcinogenese mekanismer [1]. I betragtning af den funktionelle betydning af genetiske polymorfier i cancer initiering og progression, er det af stor betydning for yderligere at undersøge den underliggende patofysiologi kræft på genniveau. Genetiske variationer, såsom ændringer i sekvens og afvigende organisationer i cellulære genom spænder fra enkelt-nukleotidsubstitutioner til brutto kromosom, føre til dannelse kræft ved biologisk regulering af en håndfuld molekylære aktiviteter.

Prostata stamcelle antigen (

PSCA

), placeret på kromosom 8q24.2, er et 123-amino-syre-cellemembranen glycoprotein, som hører til LY-6 /Thy-1-familien af ​​celleoverfladeantigener.

PSCA

blev rapporteret som en celleoverflademarkør at over-express i prostatacancercellelinjer i forhold til de normale væv [2]. Høj ekspression af

PSCA

er signifikant associeret med ugunstige prognostiske funktioner, herunder Gleason score, sædblæren invasion og kapsulært inddragelse [3], samt cancer sværhedsgrad og metastase [4]. Desuden

PSCA

er opreguleret i flere solide tumorer (bugspytkirtel, blære, renalcellecarcinom og ovarie mucinøs) [2,5], og ned-reguleret i spiserøret kræft, gastrisk kræft og galdeblæren karcinom [ ,,,0],6-8]. Men der er ingen afgørende beviser for rollen som

PSCA

udtryk i kræft carcinogenese bortset et forslag, at ekspressionen af ​​

PSCA

varierer afhængigt af cellulær kontekst [5].

To nylige GWAS baseret på individer med forskellig etnisk oprindelse viste rs2294008 polymorfi i

PSCA

er en væsentlig risikofaktor for øget gastrisk kræft modtagelighed i kaukasisk population [9], mens deceases gastrisk kræftrisiko i asiatiske befolkning [10 ]. rs2294008 polymorfisme i det første exon af

PSCA

gen kan have betydelig indflydelse på variationerne i transkriptionsaktivitet af et opstrøms fragment af

PSCA

[8]. Til dato, selv om akkumulere data har dokumenteret sammenhængen mellem

PSCA

rs2294008 polymorfi og kræftrisiko, dokumentation for rolle polymorfi som en genetisk markør for kræftrisiko stadig usikkert [9-14]. De fleste af de undersøgelser fokuseret på en enkelt type kræft med en forholdsvis lille stikprøve. Som et resultat, virkningerne af

PSCA

rs2294008 polymorfi på risikoen kræft kan undervurderes og mindre pålidelige. I dette arbejde, derfor, med det formål at bestemme forholdet mellem

PSCA

rs2294008 polymorfi og kræftrisiko og præcist vurdere estimatet af foreningen effekt størrelse, vi foretaget en meta-analyse ved hjælp af alle tilgængelige publicerede data.

Materialer og metoder

Søg strategi

Undersøgelser undersøge sammenhængen mellem

PSCA

rs2294008 polymorfi og kræftrisiko blev grundigt gennemsøgt i Embase og PubMed ved hjælp af følgende emner vilkår: “

PSCA

“, “prostata stamcelle antigen”, “varianter”, “polymorfi”, “polymorfismer”, og “kræft” af to uafhængige undersøgere. Ingen begrænsninger offentliggørelse sprog eller et minimum antal forsøgspersoner blev defineret for denne søgning. Yderligere publicerede data blev identificeret ved at gennemgå de bibliografiske referencer, der er anført i hvert hentet artikel.

Inklusionskriterier og eksklusionskriterier

For at minimere heterogenitet og lette en passende fortolkning af resultaterne, valgte vi undersøgelserne berettiget til denne meta-analyse baseret på følgende kriterier: (a) vurderede sammenhængen mellem

PSCA

rs2294008 polymorfi og kræftrisiko ved hjælp af en case-kontrol design; (B) forudsat tilgængelig frekvens for hver genotype (CC, CT, TT) i begge tilfælde og kontroller til at beregne odds ratio (OR) og tilsvarende konfidensinterval 95% (CIS). I en sag, som en samme sag serie senere blev brugt i en ny artikel, vi betragtes som den største. Undersøgelserne blev udelukket, hvis de var:. Anmeldelser, ledere, kommentarer eller dyreforsøg

Dataudtræk

dataudtræk blev afsluttet ved de to uafhængige efterforskere ansvarlige for litteratursøgningen. De indsamlede oplysninger formular hver publikation var som følger: første forfatterens navn, udgivelsesår, undersøgelse land, etniske oprindelse af de inkluderede emner (kaukasiske eller asiatiske), metoder udført for genotypning, kilde til kontroller (hospitals- eller population-baserede), type kræft, samlede antal sager og kontroller, og hyppigheden af ​​

PSCA

rs2294008 genotyper mellem cases og kontrolpersoner. En konsensus om de udtrukne poster blev nået ved drøftelser mellem de to efterforskere.

Statistisk analyse

For at vurdere sammenhængen mellem

PSCA

rs2294008 polymorfi og kræftrisiko, den yderste periferi og tilsvarende 95% CIs blev opsummeret for hver undersøgelse i TT vs CC, TT + CT vs CC, TT vs CT + CC, T vs C og CT vs CC-modeller. Undergruppe analyse blev udført i overensstemmelse med etnicitet og kræft type (mavekræft, blærekræft og andre, når berørt af mindre end tre studier).

Heterogenitet er graden af ​​variationer blandt udfald mellem forskellige undersøgelser indgår i en samme meta- analyse. Chi-square baserede Q-test blev vedtaget at påvise heterogenitet på tværs af undersøgelser på dette meta-analyse.

P

0,10 blev betragtet som statistisk signifikant. I dette tilfælde blev de samlede yderste periferi beregnet af tilfældige effekter model (Der Simonian og Laird) [15]; ellers blev den faste effekter model (Mantel-Haenszel-metoden), der anvendes [16].

Følsomhedsanalyse blev udført for at identificere den undersøgelse, der påvirkede homogenitet af de inkluderede studier, hvor betydelig heterogenitet blev angivet. Hardy-Weinberg ligevægt (HWE) i kontrolgruppen blev kontrolleret ved chi-square test. Offentliggørelse skævhed blev undersøgt af to almindeligt anvendte analytiske værktøjer: tragt plot og Egger s lineær regression test [17]

De statistiske analyser for den foreliggende undersøgelse blev udført ved hjælp af Stata software (version 12.0, StataCorp LP, College Station. , TX, USA). Alle tests var to-sidet og signifikansniveau blev fastholdt på

P

. 0,10

Resultater

Study valg

Vi opnåede 535 artikler matcher den fag begreb, der anvendes i søgningen strategi. Efter at have gennemgået deres titler og abstracts, valgte vi 30 artikler i fuldtekst for berettigelse evaluering. Blandt disse var ni endelig slettet af forskellige årsager, herunder utilstrækkelige data [18-22], oversigtsartikler [23,24], med ingen kontrol befolkning [25] og forskning irrelevant for den aktuelt undersøgte polymorfi [26]. Derfor blev 27, 197 kræfttilfælde og 48, 237 kontroller fra 21 artikler med 24 undersøgelser, som indgår i denne metaanalyse [4,8-14,27-39] (figur 1).

Karakteristik af inkluderede studier

De grundlæggende karakteristika for alle inkluderede studier er anført i tabel 1. i alt fireogtyve studier var berettiget til denne meta-analyse, blandt hvilke otte var for kaukasiske personer og seksten til asiatiske patienter. Der var store forskelle i litteraturen med hensyn til antallet af deltagere i hver undersøgelse, varierende fra 77 til 5, 303 i tilfælde gruppen og fra 200 til 16, 567 i kontrol befolkning. Kun to studier afveg fra p-værdier for HWE [10,33]

PCR-RFLP:. Polymerasekædereaktion-restriktion polymorfisme; PCR-LDR: PCR-ligering påvisningsreaktion; DHPLC: denaturering højtydende væskekromatografi; AS-PCR: allelspecifik PCR; SNP: enkelt nukleotid polymorfisme, PB: populationsbaseret undersøgelser; HB:. Hospitalsbaserede studier

Kvantitativ syntese

Ved at samle alle berettigede undersøgelser til ét stort datasæt, fandt vi sammenhængen mellem

PSCA

rs2294008 polymorfi og kræft risikoen var statistisk signifikant. Foreningen optrådte mere udtalt i TT vs CC og TT vs CT + CC: OR = 1,18, 95% CI, 1,10-1,27 (figur 2); OR = 1,14, 95% CI, 1,07-1,21, hhv. Vi bemærkede også en moderat stigning hjælp TT + CT vs CC (OR = 1,08, 95% CI, 1,05-1,10) (figur 3), T vs C (OR = 1,10, 95% CI, 1,06-1,14), og CT vs CC (OR = 1,10, 95% CI, 1,06-1,13) (tabel 2).

for hver undersøgelse, skønnene over OR og dets 95% CI blev afbildet med en kasse og en vandret linje. Symbolet fyldt diamant angiver samles OR og dets 95% CI. Tilfældige effekter meta-analyse viser en signifikant sammenhæng.

For hver undersøgelse, skønnene over OR og dets 95% CI blev afbildet med en kasse og en vandret linje. Symbolet fyldt diamant angiver samles OR og dets 95% CI. Faste effekter meta-analyse viser en signifikant sammenhæng.

P, p-værdi på Q-test for heterogenitet.

Stratificering analyser for forskellige kræftform viste tilsvarende øget risiko i gastrisk cancer og blærecancer. Når stratificering befolkningerne efter etnicitet, både asiatiske og kaukasiske populationer viste en tendens til en stigning i risikoen for kræft (tabel 2).

heterogenitet og følsomhedsanalyser

På grund af betydelig heterogenitet på tværs undersøgelser (TT vs CC:

P

= 0,007; TT vs CT + CC:

P

= 0,029; T vs C:

P

= 0,007), følsomhedsanalyse af gentagelse metaanalysen mens udelade hver undersøgelse, en ad gangen, blev udført for at identificere kilden. Resultaterne viste Matsuo et al. [27] gjort store bidrag til den bemærkelsesværdige heterogenitet. Udelukkelsen af ​​denne undersøgelse faldt dramatisk heterogenitet (TT vs CC:

P

= 0,440; TT vs CT + CC:

P

= 0,710; T vs C:

P

= 0,245). Imidlertid blev de kombinerede resultaterne ikke statistisk påvirket ved at udelukke hver undersøgelse, herunder studiet i uenighed med HWE. Disse data tydede på, at vores resultater er stabile og robuste.

Offentliggørelse skævhed

Begg s tragt plot og Egger test blev anvendt til at bestemme publikationsbias i denne meta-analyse. Der var ingen tydelig asymmetri angivet i parceller. Egger test også understøttende dokumentation for nogen væsentlig publikationsbias i meta-analyse (Begg:

P

= 0,442; Egger:

P

= 0,316; model: TT + CT vs CC) ( fig 4).

Hvert punkt repræsenterer en individuel studieplan for den angivne forening.

diskussion

PSCA

som en prostata-specifikt antigen spiller en nøglerolle i celleadhæsion, proliferation og overlevelse [40]. Serumniveauet var direkte eller indirekte i forbindelse med cancer progression.

PSCA

overekspression blev oprindeligt rapporteret i prostatakræft [2], efterfulgt af flere andre kræftformer, såsom kræft i bugspytkirtlen [41,42]. Undersøgelser af sammenhængen mellem

PSCA

rs2294008 polymorfi og kræftrisiko er ofte udført i enten en lille eller stor befolkning til at identificere forholdet. I øjeblikket er der ingen ensartet dokumentation for denne forening. Nogle undersøgelser indikerede rs2294008 polymorfi af

PSCA

gen kan have en væsentlig rolle i blæren carcinogenese og det kunne fungere som en biomarkør for genetisk disposition for denne kræft [37,38], mens dette fund modsiges en følgende replikation undersøgelse om mavekræft i japanske befolkning, hvor en nedsat risiko for mavekræft blev foreslået [10]. En mest nylig undersøgelse, men selv viste ingen genotypeassociation mellem

PSCA

rs2294008 polymorfi og risikoen for colorectal cancer. I betragtning af den relativt begrænsede stikprøvestørrelse, er af ubestemt varighed til at bestemme en stabil effekt størrelse på

PSCA

rs2294008 polymorfi i forhold til kræft.

Meta-analyse er blevet bredt accepteret som et vigtigt redskab at analysere kumulative data fra undersøgelser i hvilket resulterer med lav statistisk styrke blev produceret på grund af de begrænsede forsøgspersoner [43]. I nærværende metaanalyse, der består af 27, 197 kræfttilfælde og 48, 237 kontroller fra 21 artikler med 24 undersøgelser, omfattende udforsket sammenhængen mellem

PSCA

rs2294008 polymorfi og kræftrisiko. De kombinerede resultater foreslog en statistisk sammenhæng med den samlede kræftrisiko. I de stratificerede analyser ifølge cancer typen fandtes forhøjede risiko for mavecancer og blærekræft angivet. I overensstemmelse med resultaterne i de tidligere analyser, lagdeling analyser etnicitet viste også

PSCA

rs2294008 polymorfi var forbundet med en øget risiko for kræft i asiatiske samt hvide befolkning.

Dette er den første undersøgelse adressering kræftrisiko forbundet med

PSCA

rs2294008 polymorfi til dato, selv om en række meta-analyser har undersøgt disposition virkninger af

PSCA

rs2294008 polymorfi på mavekræft [6.060 sager og 4.824 kontroller, 10,717 tilfælde og 9.028 kontroller, 10.836 tilfælde og 9.235 kontroller i den undersøgelse, som Wang et al., Zhang et al. (Asian Pac J Cancer forrige), Zhang et al. (Exp Ther Med), henholdsvis] [44-46]. Alle disse undersøgelser viste PSCA rs2294008 polymorfi er en risikofaktor for udvikling af gastrisk cancer, en observation er i overensstemmelse med det aktuelle arbejde (55,363 flere deltagere selv i forhold til den største undersøgelse), som blev udvidet via optagelse af flere efterfølgende offentliggjorte undersøgelser. Henvisningen til øget cancer modtagelighed indebærer, at variation af rs2294008 polymorfisme fører til unormal ekspression af PSCA dermed fremme udviklingen af ​​kræft uanset cancertype eller etnisk oprindelse.

Det er kendt, at H. pylori-infektion er en overvejende og specifikke infektiøs årsag til human cancer, gastrisk cancer i særdeleshed. Forskellige linjer af beviser har vist den vigtige rolle, H. pylori-infektion spiller i mavekræft. For eksempel, Levi et al. rapporterede, at ikke kun H. pylori infektion selv fungerer som en modtagelighed faktor, men det kan have additive virkninger på gastrisk carcinogenese ved at kombinere med andre forstyrrende faktorer [47]. Næsten samtidig, Wang et al. forudsat yderligere beviser for, at vedvarende H. pylori infektion og infektionen-induceret kronisk inflammation kan øge sandsynligheden for gastrisk Cardia kræft i kinesisk [48]. Også Lunet et al. indikerede, at H. Pylori har stor indflydelse med virkningerne varierende udførligt på tværs af geografiske områder på grund af de forskellige livsstil og eksponering for miljømæssige kræftfremkaldende stoffer [49]. Disse rapporter synes at støtte vores resultater af lidt lavere risiko for kræft forbundet med rs2294008 genotyper, sammenlignet rapporteret i en tidligere forening undersøgelse af H. pylori-infektion [36]. Denne forskel indikerer, at rs2294008 polymorfi i forhold til andre carcinogener, såsom infektion med H. pylori, bidrager en mindre del til carcinogenese. Ætiologien for kræft er multifaktoriel og heterogen, yderligere undersøgelser for at identificere de risikofaktorer, hvilket vil lette en tidlig opsporing og forebyggelse.

Der er et betydeligt mellem-studie heterogenitet i denne meta-analyse. Selv om der ikke væsentlig ændring blev fundet i de kombinerede resultater, når du fjerner undersøgelsen donere heterogenitet, kan vi ikke udelukke den potentielle indflydelse og de nyeste resultater bør behandles med forsigtighed. Desuden i form af moderat stikprøvestørrelse i stratificerede analyser, er det stadig ubeslutsomme om stabile effekt størrelse

PSCA

rs2294008 polymorfi i forbindelse med risiko kræft. Endelig afgang fra HWE blev påvist i to studier. Ved at sammenligne resultaterne mellem inklusive og eksklusive dem, observerede vi mindre vekslen i resultaterne undlader at nå det betydeligt niveau. Ikke desto mindre, i lyset af få betydelige virkninger som følge af tilstedeværelsen af ​​heterogenitet og afrejse formular HWE, vores resultater er pålidelige baseret på statistiske beviser.

Sammenfattende denne meta-analyse foreslog, at

PSCA

rs2294008 polymorfi var signifikant forbundet med øget risiko for kræft. Stratificerede analyser kræft type og etnicitet viste lignende resultater. Men det er værd at udføre store undersøgelser i fremtiden at validere de nuværende resultater.

Støtte Information

S1 PRISMA Tjekliste.

doi: 10,1371 /journal.pone.0136269.s001

(DOC)

Be the first to comment

Leave a Reply