PLoS ONE: Medvirkende rolle Fem Almindelige Polymorphisms af RAGE og APE1 Gener i lungekræft blandt han-kinesere

Abstrakt

Baggrund

Lungekræft er den hyppigste årsag til kræft dødelighed i Kina. I betragtning af den allestedsnærværende karakter af gen-til-gen-interaktion i lunge carcinogenese, vi søgte at evaluere fem fælles polymorfier fra avanceret glycosylerings slutprodukt-specifik receptor (

RAGE

) og apurin- /apyrimidinisk endonuclease 1 (

APE1

) gener i forbindelse med lungekræft blandt Han kinesere.

Metoder og Resultater

819 patienter med lungekræft og 803 kræft-fri kontroller blev rekrutteret fra Qiqihar byen. Genotyper af fem undersøgte polymorfier (

RAGE

gen: rs1800625, rs1800624, rs2070600;

APE1

gen: rs1760944, rs1130409) blev bestemt ved ligase påvisning reaktion metode. Data blev analyseret ved hjælp af software og multifactor dimensionalitet reduktion R (MDR). Hardy-Weinberg ligevægt var opfyldt for alle fem polymorfier. Samlet forskelle i genotype og allel distributioner var signifikante for rs1800625 (P

genotype 0,0005; P

allel 0,0005), rs2070600 (P

genotype = 0,005; P

allel = 0,004) og rs1130409 (P

genotype = 0,009; P

allel = 0,004) polymorfier. Haplotype CAA (alleler i rækkefølge efter rs1800625, rs1800624 og rs2070600) af

RAGE

genet blev overrepræsenteret i patienter, og tillagt en 2,1 gange øget risiko for lungekræft (95% konfidensinterval: 1,52-2,91), uafhængig af forstyrrende faktorer. Yderligere anvendelse af MDR metode til fem undersøgte polymorfier identificeret den samlede bedste interaktion model herunder rs2070600 og rs1130409 polymorfier. Denne model havde en maksimal test nøjagtighed på 64,63% og en maksimal krydsvalidering sammenhæng i 9 ud af 10 ved betydelig grad af 0,006.

Konklusioner

Vores resultater viste en potentiel interaktiv bidrag

RAGE

og

APE1

gener til patogenesen af ​​lungekræft blandt han-kinesere. Yderligere undersøgelser er berettiget til at bekræfte eller afkræfte disse resultater

Henvisning:. Pan H, Niu W, han L, Wang B, Cao J, Zhao F, et al. (2013) Medvirkende rolle fem fælles Polymorphisms af

RAGE

APE1

Gener i lungekræft blandt han-kinesere. PLoS ONE 8 (7): e69018. doi: 10,1371 /journal.pone.0069018

Redaktør: Giuseppe Novelli, Tor Vergata-universitetet i Rom, Italien

Modtaget: Marts 7, 2013; Accepteret: Juni 2, 2013; Udgivet: 11. juli 2013