PLoS ONE: Genome-Wide Transkriptionelle Virkninger af Anti-Cancer Agent Camptothecin

Abstrakt

Den anti-cancer stof camptothecin hæmmer replikation og transkription ved at fange DNA topoisomerase I (Top1) kovalent til DNA i en “spalteligt kompleks”. For at undersøge effekten af ​​camptothecin på RNA-syntese genom-dækkende vi brugte Bru-Seq og vise, at camptothecin behandling primært påvirket transskription forlængelse. Vi bemærkede også, at camptothecin øget RNA læser forbi transskriptionsstopsteder samt ved enhancerelementer. Efter fjernelse af camptothecin, transskription spredes som en bølge fra 5′-enden af ​​gener uden genvinding af transskription fremgår RNA-polymeraser gået i stå i kroppen af ​​gener. Som et resultat, camptothecin inhiberede fortrinsvis ekspressionen af ​​store gener, såsom proto-onkogener og anti-apoptotiske gener mens mindre ribosomale protein gener, pro-apoptotiske gener og p53 målgener viste relativ højere ekspression. Cockayne syndrome type B-fibroblaster (CS-B), som er defekte i transkription-koblet reparation (TCR), viste en RNA-syntese recoveryprofil ligner normale fibroblaster antyder, at TCR ikke er involveret i reparation af eller RNA-syntese indvinding fra transcription- blokerer top1 læsioner. Disse resultater af virkningerne af camptothecin på transskription har stor betydning for sine anti-cancer aktiviteter og kan støtte i udformningen af ​​forbedrede kombinatoriske behandlinger, der omfatter top1 giftstoffer.

Henvisning: Veloso A, Biewen B, Paulsen MT, Berg N, Carmo de Andrade Lima L, Prasad J, et al. (2013) Genom-Wide Transkriptionelle Virkninger af Anti-Cancer Agent Camptothecin. PLoS ONE 8 (10): e78190. doi: 10,1371 /journal.pone.0078190

Redaktør: Didier Auboeuf, INSERM, Frankrig

Modtaget: Juni 5, 2013; Accepteret: September 2, 2013; Udgivet: 23. oktober 2013